Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr01 113035596 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  113035596

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  264  of  378  ( 45343 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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20
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1.69
Indices
Period
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Copy
Number
Consensus
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Percent
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Score
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16
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1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
A
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Entropy
(0-2)
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15
11
1.66
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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10
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11
1.64
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15
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28
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22
1.98
79368697--79368868
93
1.8
93
91
2
283
28
29
20
21
1.98
79381852--79382066
40
5.3
40
90
0
295
26
23
26
23
2.00
79400047--79400107
10
5.9
10
77
11
61
37
11
18
32
1.86
79400047--79400107
21
2.9
21
80
4
79
37
11
18
32
1.86
79404099--79404249
40
3.8
40
75
15
134
27
23
26
23
2.00
79404135--79404265
40
3.3
40
79
6
158
25
22
27
24
2.00
79415493--79415624
29
4.6
29
83
1
149
25
32
16
25
1.96
79423422--79423553
29
4.6
29
83
1
149
25
32
16
25
1.96
79427115--79427296
40
4.6
40
85
9
248
24
23
27
24
2.00
79427114--79427296
79
2.3
81
85
7
259
25
22
27
24
2.00
79427144--79427331
79
2.4
79
83
7
222
27
21
26
24
1.99
79430082--79430142
10
5.9
10
75
11
52
36
9
21
32
1.86
79430082--79430158
21
3.7
20
77
5
73
35
11
19
33
1.88
79430190--79430247
24
2.4
25
78
16
68
31
22
22
24
1.99
79432332--79432435
40
2.6
39
80
8
122
25
18
25
31
1.97
79432460--79432538
28
2.8
28
78
0
77
30
18
27
22
1.98
79435157--79435335
50
3.6
50
81
5
170
30
19
28
21
1.98
79435210--79435381
47
3.6
47
85
6
204
29
17
26
26
1.97
79435354--79435455
43
2.4
43
76
3
107
27
15
25
31
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
79441538--79441672
50
2.7
50
81
6
166
29
17
31
21
1.96
79445827--79445940
27
4.2
28
83
10
116
35
21
22
20
1.96
79447753--79447811
28
2.2
28
84
6
77
54
20
6
18
1.66
79448119--79448204
28
3.1
28
68
0
82
32
16
27
23
1.96
79451206--79451314
27
4.0
27
85
2
121
27
16
18
37
1.92
79451238--79451326
27
3.3
27
82
6
108
31
11
16
40
1.84
79451306--79451592
27
10.6
27
77
10
169
28
9
22
39
1.85
79451254--79451592
54
6.3
54
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6
255
29
9
21
39
1.85
79451305--79451592
81
3.5
80
79
6
287
29
9
22
39
1.85
79454069--79454108
16
2.5
16
79
0
53
72
0
5
22
1.04
79461852--79462015
40
4.1
40
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6
188
25
20
28
26
1.99
79461852--79462029
80
2.2
80
83
4
209
25
20
27
25
1.99
79471754--79471902
80
1.9
80
81
2
183
22
30
24
22
1.99
79471795--79471902
40
2.7
38
85
8
128
21
29
25
23
1.99
79474880--79475101
64
3.4
65
76
9
218
23
28
15
31
1.96
79474979--79475129
68
2.3
68
79
8
161
25
28
15
30
1.96
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40
6.2
40
90
1
385
25
24
28
22
1.99
79488181--79488430
40
6.2
40
90
1
385
25
24
28
22
1.99
79499609--79499737
66
2.0
66
85
3
179
29
17
24
29
1.97
79501175--79501241
26
2.6
26
92
0
107
23
22
28
25
1.99
79505638--79505799
39
4.2
39
92
1
254
23
19
32
24
1.98
79505638--79505829
39
4.9
39
89
1
242
23
20
31
23
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
79508195--79508402
40
5.2
40
83
1
231
25
26
22
25
2.00
79516252--79516458
40
5.2
39
85
4
240
25
28
22
24
2.00
79518497--79518560
32
2.0
32
96
0
119
29
15
23
31
1.95
79527282--79527372
29
3.2
27
84
7
119
29
14
27
28
1.95
79528420--79528493
36
2.1
36
100
0
148
33
14
8
43
1.75
79528420--79528502
36
2.3
36
93
4
132
31
16
8
43
1.78
79531282--79531370
28
3.1
28
79
10
101
29
13
28
29
1.94
79535349--79535455
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2.5
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8
128
27
14
23
34
1.94
79548943--79549172
48
4.9
48
76
7
211
28
25
20
25
1.99
79551356--79551570
40
5.3
40
88
0
277
26
23
26
24
2.00

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378