Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr01 113035596 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  113035596

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  76  of  378  ( 45343 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
20315012--20315106
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1.9
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0
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251
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3.0
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1.9
65
96
0
230
27
25
11
35
1.90
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1
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2.3
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30
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12
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1.74
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11
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1.73
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2.1
40
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0
0
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1.93
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3.8
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21
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1.99
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56
44
0
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50
1.25
20454568--20454603
19
1.9
18
88
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54
44
0
5
50
1.25
20455599--20455649
22
2.3
22
86
0
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35
15
27
21
1.94
20460219--20460313
35
2.7
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35
26
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28
1.88
20461683--20461753
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3.5
20
78
5
81
43
15
8
32
1.77
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
20465163--20465198
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16
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2.5
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10
18
1.82
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20
1.9
20
88
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58
34
2
10
52
1.50
20475917--20475985
28
2.5
28
95
2
122
43
27
10
18
1.82
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2.1
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20
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4.0
28
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29
28
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1.95
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26
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3
80
5
1
29
63
1.27
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
20547313--20547348
11
3.2
11
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11
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1.18
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26
29
1.97
20559309--20559349
21
2.0
21
90
0
64
29
26
17
26
1.97
20559380--20559447
31
2.2
32
79
10
79
23
7
22
47
1.76
20559998--20560030
11
2.9
12
86
13
52
33
0
0
66
0.92
20560243--20560291
22
2.2
22
77
0
53
63
10
8
18
1.50
20566731--20566760
5
5.8
5
96
4
51
3
60
36
0
1.14
20566829--20566857
12
2.4
12
100
0
58
68
0
0
31
0.89
20566783--20566846
26
2.6
24
79
11
76
64
1
0
34
1.03
20566786--20566872
21
4.0
20
73
22
61
67
2
0
29
1.03
20567477--20567530
28
1.9
28
85
7
74
37
0
1
61
1.07
20577559--20577614
24
2.3
24
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0
85
26
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10
46
1.79
20579128--20579164
2
18.5
2
100
0
74
48
0
0
51
1.00
20579254--20579301
3
15.7
3
95
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31
2
0
66
1.03
20582358--20582410
26
2.0
26
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45
3
1
49
1.31
20582877--20582942
14
4.3
15
73
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45
0
1
53
1.09
20590965--20590999
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13
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0
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42
22
5
28
1.76
20593457--20593484
5
5.6
5
100
0
56
21
0
0
78
0.75
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15
3.5
15
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10
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28
7
0
63
1.22
20594016--20594066
22
2.5
21
82
17
63
27
5
1
64
1.27
20593989--20594103
29
4.0
29
69
13
83
26
7
2
63
1.35
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
20594038--20594124
44
2.0
44
81
4
104
26
8
1
64
1.28
20594263--20594357
25
3.7
25
70
10
66
31
7
2
58
1.37
20594328--20594381
23
2.5
22
82
8
58
33
0
5
61
1.19
20606342--20606370
15
1.9
15
100
0
58
55
0
20
24
1.44
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39
2.0
39
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0
147
25
21
20
32
1.98
20609407--20609502
50
1.9
50
86
0
138
35
14
20
29
1.93
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17
2.1
17
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0
61
51
5
20
22
1.68
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2
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2
100
0
70
51
0
0
48
1.00
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2.3
50
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3
151
40
19
16
24
1.91
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18
2.4
19
81
7
56
46
0
6
46
1.29
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13
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14
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0
38
1.30
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11
3.2
11
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4
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66
0
2
30
1.06
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2
21.5
2
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77
50
0
0
50
1.00
20629389--20629440
19
2.8
19
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8
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50
1
1
46
1.23
20631323--20631406
26
3.2
26
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0
150
33
4
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1.77
20632894--20632946
26
2.0
26
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7
72
37
22
15
24
1.92
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17
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17
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10
88
36
5
16
41
1.72
20637981--20638049
30
2.3
30
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0
111
39
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10
46
1.58
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50
3.5
50
88
0
264
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16
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25
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20641884--20642001
31
3.8
31
89
0
173
27
20
26
25
1.99
20642023--20642226
42
4.5
46
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8
214
28
14
26
29
1.95
20663919--20664300
196
1.9
196
85
1
514
35
28
13
22
1.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
20666102--20666144
10
4.4
10
79
2
52
48
20
2
27
1.62
20673426--20673480
26
2.0
28
93
6
96
34
7
0
58
1.26
20675368--20675405
20
1.9
20
89
10
60
50
0
13
36
1.42
20678494--20678652
27
5.9
27
82
11
184
34
22
24
18
1.96
20678512--20678655
54
2.7
54
94
2
245
34
23
24
17
1.96
20679042--20679071
8
3.8
8
90
0
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3
26
26
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26
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0
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200
31
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1.98
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2.3
39
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0
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5
17
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1.71
20693012--20693138
28
4.5
28
86
0
155
30
20
22
26
1.98

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378