Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr01 113035596 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  113035596

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
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This is table  303  of  378  ( 45343 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
91795204--91795248
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23
2.00
91812514--91812738
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1.9
119
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2.1
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4.2
27
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135
19
23
23
33
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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53
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22
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91852045--91852161
27
4.4
26
79
14
105
22
25
18
33
1.97
91852029--91852161
53
2.5
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170
20
24
21
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1.97
91857300--91857369
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1.10
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0
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2
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0
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20
8
28
1.82
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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91910151--91910510
138
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138
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381
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20
18
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1.93
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1.95
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1.9
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17
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86
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295
20
21
22
35
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
91974890--91974941
19
2.7
20
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1.74
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38
0
40
1.53
91975723--91975811
45
2.0
45
100
0
178
20
39
0
40
1.52
91981437--91981512
3
25.3
3
91
0
125
63
0
3
32
1.13
91981511--91981544
3
11.3
3
87
0
50
67
26
0
5
1.13
91981508--91981544
12
3.1
12
92
0
56
67
24
0
8
1.17
91981713--91981768
28
2.0
27
82
3
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71
1
5
21
1.15
91985324--91985431
53
2.0
53
85
0
144
18
25
17
38
1.92
91991866--91992069
53
3.8
54
78
1
212
20
24
18
36
1.94
91991878--91992061
55
3.4
53
79
2
170
20
25
19
35
1.95
91995226--91995277
23
2.3
23
86
3
70
61
1
0
36
1.07
91996049--91996083
16
2.2
16
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0
61
31
25
0
42
1.55
91998129--91998274
43
3.4
43
75
9
147
26
27
19
27
1.99
92002867--92002891
7
3.6
7
100
0
50
28
0
12
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1.32
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18
2.1
18
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0
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23
26
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39
1.87
92007074--92007468
126
3.1
126
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5
530
29
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16
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1.91
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35
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45
27
0
26
1.54
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30
2.1
30
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0
101
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1.90
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2
21.0
2
100
0
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0
0
50
1.00
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2
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2
100
0
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48
0
0
51
1.00
92022827--92022870
14
3.1
14
80
6
52
13
9
0
77
0.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
92024637--92024696
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5
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75
18
0
1
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0.80
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6
13.5
6
85
6
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15
1
3
79
0.95
92024638--92024714
30
2.8
28
83
11
95
15
1
3
79
0.95
92025113--92025138
7
3.7
7
100
0
52
0
11
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42
1.40
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29
3.4
29
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1
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25
16
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1.96
92026622--92026730
57
1.9
57
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1
155
26
15
30
27
1.96
92026607--92026719
29
4.0
29
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133
27
15
29
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1.96
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1.83
92036536--92036703
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40
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26
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1
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1.9
94
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31
19
28
21
1.97
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47
4.8
47
75
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206
29
19
29
22
1.98
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49
1.9
49
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4
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1.91
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29
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1.98
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2.7
50
80
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153
33
18
25
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1.97
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11
100
0
50
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0
0
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13
5
31
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1.63
92055552--92055582
2
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2
100
0
62
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48
0
0
1.00
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2
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0
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0
2
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20
2.0
20
94
0
69
20
12
17
48
1.80
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
92061867--92061956
45
2.0
45
95
0
162
54
4
6
34
1.47
92061877--92061952
22
3.4
21
71
18
64
56
3
7
31
1.46
92070575--92070599
2
12.5
2
100
0
50
52
0
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0
1.00
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2.0
43
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0
154
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29
1.76
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2.4
44
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144
29
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44
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144
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17
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0
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0
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37
93
0
287
26
31
18
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1.97
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47
9.9
47
92
0
727
26
29
11
31
1.92

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378