Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr01 113035596 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  113035596

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  311  of  378  ( 45343 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.0
39
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Percent
Indels
Score
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2.3
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175
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22
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1.99
94697000--94697167
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230
23
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18
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1.9
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2.2
17
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4
51
41
12
10
35
1.77
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.96
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1.9
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7
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1.57
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207
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1.97
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1.89
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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(0-2)
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25
1.94
94831754--94831818
33
2.0
33
100
0
130
27
9
16
46
1.78
94835057--94835186
40
3.2
40
82
4
165
23
24
28
23
2.00
94843070--94843219
40
3.8
40
80
5
155
26
24
27
22
1.99
94846908--94846994
16
5.1
17
70
21
58
35
3
2
58
1.27
94847080--94847152
23
3.4
22
72
18
64
24
5
2
67
1.26
94847126--94847172
19
2.4
20
80
20
55
23
0
6
70
1.10
94847207--94847235
2
15.0
2
92
7
51
48
0
0
51
1.00
94847728--94847763
16
2.2
17
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5
56
22
11
8
58
1.59
94850105--94850141
2
18.5
2
94
0
65
54
0
0
45
1.00
94851681--94851749
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1.9
36
100
0
138
14
13
8
63
1.51
94855112--94855353
132
1.8
132
87
1
360
29
19
17
33
1.95
94855140--94855395
132
1.9
132
84
1
343
28
20
18
32
1.96
94886643--94886716
18
4.2
17
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15
53
33
2
0
63
1.09
94886668--94886720
13
3.9
13
75
18
54
37
1
0
60
1.08
94887941--94888025
40
2.1
40
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4
100
36
21
2
40
1.66
94889194--94889250
27
2.1
27
100
0
114
38
29
17
14
1.89
94894485--94894588
52
2.0
52
83
3
129
41
7
20
30
1.80
94899995--94900057
22
2.9
22
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2
101
23
25
39
11
1.88
94900195--94900232
13
2.9
13
88
0
58
0
39
28
31
1.57
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
94901222--94901478
47
5.5
46
77
9
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24
29
19
27
1.98
94901220--94901446
93
2.4
93
81
10
275
23
29
18
27
1.98
94911990--94912086
28
3.5
28
88
4
144
21
8
24
45
1.79
94912707--94912768
27
2.3
27
91
0
97
27
16
16
40
1.89
94912725--94912874
54
2.8
54
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142
29
9
19
42
1.82
94912722--94912874
81
1.9
81
83
5
202
30
9
19
41
1.82
94912751--94912874
27
4.6
27
82
2
151
29
7
20
42
1.79
94912858--94912928
27
2.6
27
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29
7
26
36
1.83
94912751--94912874
54
2.3
54
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2
187
29
7
20
42
1.79
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2.0
34
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2
127
26
11
28
32
1.92
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1.9
39
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5
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3
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1.40
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1.9
23
100
0
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22
4
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1.48
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23
2.3
23
90
3
81
20
3
14
61
1.49
94922050--94922091
19
2.2
19
87
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2
2
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1.13
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18
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0
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2
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2
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0
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0
50
0
50
1.00
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31
7
10
50
1.66
94931913--94932032
23
5.1
23
75
13
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20
21
19
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94936738--94936768
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16
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132
27
22
17
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1.97
94943888--94944043
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1.9
84
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2
224
26
23
17
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94955081--94955262
46
4.0
46
88
0
247
41
14
22
21
1.89
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
94960284--94960465
46
4.0
46
88
0
247
41
14
22
21
1.89
94977351--94977385
1
35.0
1
88
0
52
94
0
5
0
0.32
94978207--94978363
44
3.6
43
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6
120
35
21
22
21
1.96
94978562--94978848
86
3.3
86
84
1
308
35
21
22
20
1.96
94980864--94980919
20
2.7
21
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10
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21
3
1
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1.08
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2.1
25
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0
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0
0
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6
100
0
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15
0
50
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29
2.3
29
91
0
105
25
7
27
39
1.83

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378