Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr01 113035596 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  113035596

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  88  of  378  ( 45343 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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18
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Score
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1.06
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
23951688--23951739
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29
1.97
23953214--23953582
177
2.1
176
81
7
392
28
19
24
27
1.99
23953526--23954304
176
4.4
176
85
4
950
30
17
23
28
1.97
23953241--23953803
308
1.8
309
86
3
830
29
19
24
27
1.98
23953791--23954036
43
5.7
43
68
12
137
30
15
25
28
1.96
23953961--23954061
43
2.3
44
79
3
114
29
16
24
28
1.97
23956712--23956772
28
2.3
27
85
5
79
31
9
19
39
1.84
23958218--23958353
26
5.2
26
98
0
236
36
24
5
33
1.80
23961033--23961093
19
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18
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11
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42
8
9
39
1.68
23961984--23962023
17
2.3
18
86
4
55
12
42
27
17
1.85
23961996--23962153
70
2.2
71
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2
282
18
39
23
17
1.92
23965919--23966054
26
5.2
26
94
0
236
33
5
25
36
1.78
23971754--23971889
26
5.2
26
94
0
236
33
5
25
36
1.78
23973678--23973711
18
1.9
17
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50
17
5
26
50
1.69
23976528--23976641
51
2.2
51
98
0
219
10
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31
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9
12
1.44
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5.0
6
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0
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0
0
50
1.00
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1.9
20
88
0
58
39
47
2
10
1.52
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38
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38
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11
241
22
22
16
38
1.93
23992425--23992538
31
3.5
31
89
8
147
23
21
14
40
1.90
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
23992425--23992564
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2.0
69
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0
271
23
21
15
39
1.92
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24
4.0
24
85
10
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26
24
21
28
1.99
23992756--23992849
47
2.0
49
85
12
133
26
24
21
27
1.99
23992901--23992960
20
3.0
20
90
0
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20
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21
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1.91
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47
2.0
48
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10
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23
21
27
1.99
24000830--24000924
23
4.0
23
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23
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29
1.99
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1.9
25
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25
16
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1.96
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0
0
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1.00
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18
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0
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4.0
40
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29
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2.1
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2
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22
20
28
27
1.99
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0
0
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5.2
19
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14
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1.80
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2.5
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19
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15
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1.82
24012316--24012346
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5
100
0
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38
0
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1.54
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16
2.3
18
91
8
64
56
17
2
23
1.53
24019009--24019072
20
3.2
22
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18
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54
0
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1.26
24019058--24019106
19
2.6
18
75
9
53
63
2
4
30
1.24
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
24019055--24019160
38
2.8
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14
117
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0
2
32
1.15
24019101--24019170
16
4.2
16
81
13
79
64
0
2
32
1.08
24019092--24019173
34
2.3
36
81
12
98
63
0
2
34
1.08
24019101--24019160
3
20.3
3
74
16
54
65
0
1
33
1.03
24019278--24019319
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2.2
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0
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1.14
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2.4
20
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0
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30
1.18
24021125--24021186
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2.8
20
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62
0
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1.20
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0
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0
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2
0.70
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1
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1
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0
50
86
0
9
3
0.67

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378