Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr01 113035596 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  113035596

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  39  of  378  ( 45343 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.1
52
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29
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16
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148
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18
14
26
1.89
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
9704770--9705017
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1.9
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160
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17
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1.9
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2.0
124
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383
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2.3
257
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2
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36
1.93
9729750--9730190
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6.1
71
69
10
297
25
16
21
36
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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17
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165
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20
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1.96
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1.9
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1.95
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14
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2.1
30
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19
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1.9
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19
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1.94
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16
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19
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92
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15
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2.0
25
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27
14
4
53
1.60
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
9749476--9749778
46
7.0
46
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7
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24
15
37
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11
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1.52
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47
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16
115
55
7
3
33
1.45
9753875--9753903
13
2.2
13
100
0
58
55
13
0
31
1.39
9753898--9753977
36
2.2
37
78
12
87
62
2
2
32
1.22
9753892--9753959
21
3.0
21
74
25
68
60
4
2
32
1.32
9753942--9753979
15
2.5
15
86
0
58
65
0
0
34
0.93
9753988--9754053
33
2.0
34
82
8
82
54
3
4
37
1.36
9754397--9755162
3
254.0
3
67
18
159
61
4
3
30
1.32
9754741--9754781
16
2.6
16
92
0
64
63
0
4
31
1.15
9754529--9755122
271
2.2
271
97
1
1111
61
4
3
30
1.32
9755012--9755052
16
2.6
16
92
0
64
63
0
4
31
1.15
9757305--9757341
2
18.5
2
100
0
74
48
0
0
51
1.00
9757698--9757770
35
2.1
35
100
0
146
31
2
26
39
1.70
9757836--9757868
2
16.5
2
93
0
57
48
3
0
48
1.17
9758565--9758598
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2.3
15
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0
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47
0
0
52
1.00
9770496--9770526
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1.9
16
100
0
62
32
16
6
45
1.72
9773071--9773158
34
2.5
35
80
10
101
46
15
6
30
1.72
9775135--9775205
32
2.2
32
80
5
81
29
4
15
50
1.63
9780777--9780804
14
2.0
14
100
0
56
21
7
7
64
1.43
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
9791953--9791997
21
2.1
21
87
0
63
2
42
17
37
1.62
9804198--9804222
9
2.8
9
100
0
50
32
0
0
68
0.90
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18
2.2
18
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0
60
56
0
0
43
0.99
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18
2.3
18
87
8
57
43
0
0
56
0.99
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25
2.0
25
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4
64
63
8
0
28
1.23
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25
2.9
23
80
15
66
66
7
0
26
1.19
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19
2.0
20
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5
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71
7
0
20
1.10
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32
2.0
32
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38
12
0
49
1.41
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51
5.0
51
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2
437
28
23
19
28
1.98
9824082--9824340
104
2.5
102
92
2
437
28
23
19
28
1.98
9826637--9826886
126
2.0
125
90
3
394
39
19
12
29
1.87
9827678--9827802
27
4.9
27
83
15
185
44
21
10
23
1.83
9827678--9827802
46
2.5
46
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10
169
44
21
10
23
1.83
9827750--9827789
19
2.1
19
100
0
80
42
15
12
30
1.83
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8.5
86
88
4
1019
37
20
16
26
1.93
9836650--9836802
77
2.0
77
92
0
252
42
18
13
25
1.87
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24
2.1
24
100
0
100
36
16
4
44
1.66
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28
2.2
28
91
0
99
31
30
6
31
1.83
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14
3.1
14
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20
52
17
36
0
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1.48
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6
5.5
6
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0
57
0
66
0
33
0.92
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19
2.0
19
94
0
67
50
10
7
31
1.66
9850578--9850633
17
3.2
17
67
18
51
55
5
5
33
1.45
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
9851830--9851992
89
1.8
89
94
0
290
44
14
11
29
1.81
9852497--9852842
87
4.0
86
84
4
428
36
16
17
29
1.92
9852519--9852842
174
1.9
174
88
1
488
38
16
16
28
1.91
9854454--9854482
7
4.1
7
100
0
58
86
0
0
13
0.58
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30
2.0
30
87
9
86
51
0
6
41
1.28
9859930--9859968
18
2.0
20
85
9
55
61
0
5
33
1.18
9860220--9860276
20
2.7
22
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20
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40
5
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47
1.53
9860601--9861029
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2.6
167
86
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582
36
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7
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9864323--9864358
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1.9
18
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5
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50
8
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1.56
9866697--9866728
16
1.9
17
93
6
57
68
0
28
3
1.04

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378