Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr01 113035596 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  113035596

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  38  of  378  ( 45343 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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G
T
Entropy
(0-2)
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1.34
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Percent
Indels
Score
A
C
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Entropy
(0-2)
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1.89
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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Entropy
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0.80
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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Entropy
(0-2)
9545558--9545600
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0
25
1.48
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2
16.0
2
100
0
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0
0
50
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15
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12
12
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16.0
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0
55
0
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46
1.00
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2.0
39
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18
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1
1
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1.20
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1.9
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10
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0
17
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25
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0
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5
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2.0
23
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0
2
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0
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0
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1.12
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2.1
20
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32
2
2
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1.20
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20
2.3
18
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14
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0
6
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3
0
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32
2.3
32
83
9
85
26
4
1
67
1.17
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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27
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46
0
7
46
1.31
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27
2.7
24
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60
0
2
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1.12
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19
2.5
19
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10
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0
2
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1.10
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24
2.6
22
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14
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58
0
3
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13
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8
35
1.66
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11
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0
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3
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3
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15
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4
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32
5
5
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1.42
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19
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2
2
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1.18
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3
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2
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1.38
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2.3
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0
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2.1
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0
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18
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10
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2.1
25
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15
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2.0
21
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0
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2.3
20
83
16
55
27
0
4
68
1.07
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
9655500--9655563
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19
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42
0
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1.16
9655509--9655557
19
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18
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44
0
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0
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13
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2.5
26
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2.0
20
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0
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0
0
45
0.99

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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