Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr01 113035596 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  113035596

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  25  of  378  ( 45343 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6217824--6217962
21
6.7
21
68
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30
4
3
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1.33
6217957--6218003
21
2.3
20
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3
58
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4
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1.39
6217957--6218004
20
2.3
21
85
3
62
35
4
4
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1.38
6221974--6222070
32
3.0
32
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0
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23
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1.82
6226025--6226067
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1.9
22
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13
61
37
2
4
55
1.33
6225989--6226084
31
3.3
28
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11
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1.46
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2.0
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2.0
23
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2
164
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7
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1.82
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1.9
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2
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6
71
20
2
0
77
0.87
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22
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1.42
6245897--6245948
10
5.1
10
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65
3
0
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1.10
6245900--6245940
19
2.0
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9
59
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2
0
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1.05
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2.6
19
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36
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3.0
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5
0
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14
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0
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2.6
16
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56
5
0
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6253214--6253275
26
2.3
27
94
5
108
3
4
22
69
1.22
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6253949--6255540
88
19.0
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17
381
35
19
18
27
1.95
6254117--6254178
30
2.1
30
87
6
90
41
27
9
20
1.84
6254275--6254309
14
2.6
14
90
4
54
51
5
14
28
1.65
6254160--6255582
167
8.5
165
80
11
1279
34
19
18
27
1.95
6254288--6255290
76
12.3
79
73
15
601
34
18
18
28
1.95
6254329--6254612
77
3.8
74
82
8
288
36
17
16
29
1.92
6254328--6254612
79
3.8
74
80
7
290
36
17
16
29
1.93
6254521--6255552
88
12.1
85
77
14
718
34
19
18
27
1.95
6254767--6254801
14
2.5
14
90
0
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57
5
20
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1.60
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91
4.0
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456
37
16
18
27
1.92
6254960--6255288
74
4.1
75
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20
204
31
20
19
28
1.97
6255036--6255211
92
2.0
89
86
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248
32
19
19
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1.97
6255269--6255303
14
2.5
14
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0
52
57
5
20
17
1.60
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181
1.9
176
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461
34
21
18
25
1.96
6255539--6255634
49
2.0
49
97
0
183
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20
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30
1.95
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72
2.0
72
95
0
255
32
16
16
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1.91
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121
2.0
121
91
0
390
32
19
17
30
1.95
6255588--6255809
72
2.9
78
82
8
188
32
18
16
32
1.93
6255778--6255883
54
1.9
54
85
9
144
37
19
15
27
1.92
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140
2.5
140
95
2
626
37
20
17
24
1.94
6256014--6256179
72
2.3
71
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4
226
42
20
14
22
1.88
6256054--6256300
122
2.0
124
89
3
383
40
22
12
24
1.89
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6256179--6256353
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2.5
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3
228
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22
13
28
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12
3.0
12
95
0
63
41
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25
27
1.77
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2
24.5
2
80
8
53
55
4
0
40
1.19
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39
2.9
35
71
15
83
55
4
4
35
1.41
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3.9
11
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50
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32
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21
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1.11
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19
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26
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1.78
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2.7
40
85
2
135
37
22
19
21
1.95
6280492--6280581
40
2.2
41
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4
137
35
20
21
23
1.96
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1.9
29
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12
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1.49
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12
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20
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15
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1.56
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0
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1.45
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52
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11
5
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1.50
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16
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2
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6291850--6291979
20
6.4
20
72
15
81
27
7
3
61
1.38
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6292072--6292106
3
11.7
3
100
0
70
31
0
0
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0.90
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2.6
12
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5
53
86
3
10
0
0.67
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1.9
19
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5
56
86
2
11
0
0.68
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20
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18
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9
60
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10
0
0.76
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6.9
76
91
2
837
32
19
23
25
1.98
6302587--6303116
154
3.5
153
92
0
864
32
19
23
25
1.98
6303047--6303178
62
2.1
62
92
0
219
31
19
21
27
1.97
6302893--6303554
216
3.0
215
87
5
968
32
18
22
25
1.97
6303106--6303632
76
7.0
76
87
3
751
33
19
22
25
1.97
6302589--6304074
300
5.0
297
85
7
1904
32
19
22
25
1.97
6302587--6304308
516
3.4
515
93
2
2732
32
18
23
25
1.97
6302589--6304308
440
3.9
435
84
8
1932
32
19
23
25
1.97
6303563--6303694
62
2.1
62
92
0
219
31
19
21
27
1.97
6303622--6304082
76
6.1
76
87
4
639
33
19
22
24
1.97
6303961--6304205
122
2.0
121
88
2
366
30
17
26
25
1.98
6303884--6304281
198
2.0
197
90
2
620
31
18
25
25
1.97
6304080--6304308
76
3.0
76
92
1
377
31
18
24
24
1.97
6313456--6313488
17
1.9
17
93
0
57
0
15
0
84
0.61
6313690--6313739
3
17.0
3
88
12
77
66
0
2
32
1.03
6320917--6321040
33
3.8
33
94
0
212
30
41
8
18
1.81
6323383--6323560
88
2.0
89
87
2
259
29
12
15
42
1.84
6335159--6335231
28
2.6
28
84
4
85
69
6
1
21
1.19
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6335247--6335291
23
2.0
23
90
0
72
62
0
4
33
1.15
6340523--6340571
22
2.3
23
86
10
68
61
0
6
32
1.21
6340553--6340604
8
5.7
9
75
20
54
69
3
0
26
1.06
6340533--6340605
21
3.8
20
74
20
66
68
2
1
27
1.11
6340630--6340663
17
2.0
17
88
0
50
58
0
5
35
1.22
6342239--6342267
14
2.0
15
93
6
51
3
13
34
48
1.60
6344382--6344416
2
17.5
2
100
0
70
48
0
0
51
1.00
6345710--6345769
31
1.9
32
86
3
86
55
6
0
38
1.27
6349820--6349849
3
10.0
3
92
0
51
30
0
3
66
1.07
6351461--6351499
18
2.2
17
86
4
51
38
0
2
58
1.12
6351469--6351529
22
2.8
21
78
11
61
37
3
4
54
1.39
6354095--6354147
25
2.1
25
100
0
106
28
24
3
43
1.71
6355930--6355982
24
2.2
24
96
0
97
28
18
15
37
1.91
6357261--6357341
24
3.4
24
66
24
62
34
3
13
48
1.60
6359997--6360039
21
2.0
21
95
0
77
37
23
4
34
1.76
6361986--6362029
18
2.5
17
92
7
70
88
0
11
0
0.51
6361992--6362032
20
2.0
21
95
4
75
87
0
12
0
0.53
6364170--6364215
19
2.5
19
76
16
53
67
0
30
2
1.03
6365002--6365229
46
5.0
47
91
2
331
21
22
14
40
1.90
6367365--6367416
11
4.7
11
76
9
52
63
3
0
32
1.12
6368116--6368157
18
2.5
17
78
21
52
38
0
7
54
1.28
6368441--6368469
13
2.2
13
100
0
58
13
0
0
86
0.58
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6368291--6369482
145
8.2
145
81
9
1233
28
8
6
56
1.53
6368291--6369482
294
4.1
296
86
6
1508
28
8
6
56
1.53
6369211--6369470
136
1.9
136
86
3
373
28
9
6
56
1.55
6369861--6369890
13
2.2
14
94
5
53
0
20
0
80
0.72
6369917--6369981
3
22.0
3
79
14
73
0
30
0
69
0.89
6370149--6370196
18
2.6
19
84
15
73
8
6
6
79
1.07
6370381--6370435
28
2.0
28
86
13
78
56
0
7
36
1.27
6371217--6371255
20
2.0
20
85
10
53
66
0
2
30
1.05
6373516--6373563
21
2.3
21
82
13
64
47
4
0
47
1.21
6373519--6373561
20
2.2
20
87
8
61
48
4
0
46
1.22

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378