Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr01 113035596 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  113035596

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  282  of  378  ( 45343 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
85019273--85019314
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2.8
16
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0
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0
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1.98
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25
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1.99
85039624--85039679
20
2.8
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23
26
22
2.00
85044650--85044779
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2.00
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222
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2.3
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246
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85060006--85060266
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1.9
140
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26
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2.0
21
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10
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1.9
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0
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220
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19
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5.0
42
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17
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132
1.9
132
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302
27
17
27
27
1.98
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2.1
19
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15
26
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0
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0
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2
37
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85075848--85076064
20
10.9
20
72
13
155
57
2
2
37
1.24
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
2
43
1.11
85075967--85076065
41
2.4
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1
137
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2
37
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0
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2
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20
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63
2
1
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2
32
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85082665--85082741
26
2.7
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2.0
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2
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85084398--85084455
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7
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0
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60
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1.20
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29
28
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1.98
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46
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140
28
28
21
21
1.99
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56
0
0
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3.7
20
68
14
57
48
19
16
15
1.82
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
85110161--85110216
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2.7
21
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14
17
1.79
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3.2
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74
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47
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16
20
1.83
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2
20.0
2
89
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48
0
2
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2.0
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0
0
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1.00
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64
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0
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25
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100
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2.2
13
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0
58
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0
51
6
1.28
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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20
25
23
1.98
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46
3.8
46
78
10
205
21
21
28
28
1.98
85193963--85194134
93
1.8
93
92
0
290
21
21
29
27
1.99
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9
4.8
9
86
10
63
68
2
0
28
1.01
85198965--85199008
19
2.3
18
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70
70
2
0
27
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0
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27
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23
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3
20
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26
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14
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15
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0
3
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19
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59
0
0
40
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19
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18
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6
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59
2
0
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25
1.12
85215548--85215724
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3.0
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2.1
31
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1.88
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7
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0
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18
2.3
19
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30
2
0
67
1.03
85218981--85219023
3
14.0
3
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13
52
30
2
0
67
1.03
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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44
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2
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86
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21
1.95
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173
2.5
172
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0
663
37
19
22
21
1.95
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69
1.9
69
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22
21
28
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2
0
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1.03
85234134--85234176
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2
0
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1.03
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0
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0
0
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60
2
2
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2.3
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0
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22
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40
3.8
40
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173
26
21
27
24
2.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
85272978--85273108
40
3.3
40
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24
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27
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11.5
47
93
0
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26
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3.3
22
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3.3
22
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73
32
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16
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3.5
11
78
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51
32
24
2
40
1.69

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378