Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr01 113035596 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  113035596

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  46  of  378  ( 45343 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
11440034--11440076
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0
0
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1.21
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31
4
1
63
1.22
11440108--11440251
7
19.7
7
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1.22
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2.0
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0
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1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2
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0
52
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20.7
9
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20
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2.8
26
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35
0
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0
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172
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10
24
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11482662--11482832
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2.4
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221
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11
23
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1.90
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0
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29
1.95
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6
181
27
14
29
28
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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58
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174
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11
23
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1.90
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21
1.9
21
94
0
71
20
12
12
55
1.69
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
0
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1
1
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11
31
1.86
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23
2.4
22
78
9
56
42
5
0
51
1.25
11568905--11568942
3
12.3
3
88
5
58
28
0
2
68
1.03
11568973--11569008
2
18.5
2
94
5
65
52
0
0
47
1.00
11570183--11570220
2
19.0
2
100
0
76
50
0
0
50
1.00
11572284--11572308
2
12.5
2
100
0
50
0
48
0
52
1.00
11584011--11584035
13
1.9
13
100
0
50
64
4
8
24
1.38
11586478--11586546
35
2.0
33
81
10
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33
4
17
44
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11587019--11587049
16
1.9
16
93
0
53
41
16
12
29
1.85
11587887--11587928
18
2.2
20
87
8
61
59
4
0
35
1.19
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19
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19
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9
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56
8
0
34
1.30
11587943--11587983
20
2.0
20
90
9
57
56
0
4
39
1.21
11587944--11587983
21
2.0
21
95
5
73
55
0
5
40
1.22
11596571--11596647
21
3.7
21
92
0
109
42
18
23
15
1.88
11596560--11596647
42
2.2
40
85
4
113
42
18
23
15
1.89
11596787--11596824
17
2.2
17
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0
58
50
10
0
39
1.37
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30
2.3
30
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5
84
47
5
19
27
1.72
11600201--11600268
21
3.1
21
87
6
73
11
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11
54
1.69
11600221--11600268
21
2.3
21
96
0
87
10
22
10
56
1.63
11600498--11600531
2
17.0
2
100
0
68
50
0
0
50
1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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46
4.6
46
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1
341
39
14
23
22
1.91
11602536--11602602
30
2.2
30
89
5
100
44
16
22
16
1.86
11602490--11602646
76
2.1
76
98
0
305
43
15
22
18
1.87
11602444--11602689
122
2.0
121
86
2
341
43
15
21
19
1.88
11602566--11602689
46
2.7
46
81
3
126
44
16
20
19
1.87
11602952--11602984
17
2.0
17
94
5
59
51
0
12
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1.39
11609293--11609417
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48
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1
162
24
14
29
31
1.95
11610157--11610201
23
2.0
22
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12
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24
11
22
42
1.86
11611130--11611306
39
4.5
39
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1
228
31
2
19
45
1.65
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30
2.0
30
100
0
120
16
3
23
56
1.55
11612718--11612762
22
2.0
22
83
8
56
51
17
0
31
1.46
11612934--11612976
22
2.0
22
90
0
68
32
18
18
30
1.95
11612919--11613176
73
3.5
73
91
0
399
36
22
16
24
1.94
11613080--11613122
22
2.0
22
95
0
77
32
16
18
32
1.93
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145
1.9
147
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1
464
45
9
30
14
1.76
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14
2.8
14
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3
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52
5
5
37
1.45
11621971--11622013
18
2.4
18
96
0
77
46
2
0
51
1.13
11627688--11627750
21
3.0
21
76
2
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33
28
25
12
1.92
11627973--11628028
29
2.0
29
89
3
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48
30
1
19
1.59
11633212--11633254
22
2.0
22
95
0
77
39
6
4
48
1.51
11633633--11633765
2
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2
100
0
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49
50
0
0
1.00
11635741--11635797
23
2.4
23
77
16
71
29
14
26
29
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
11645401--11645444
22
1.9
24
90
9
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25
20
0
54
1.45
11646479--11646530
5
10.6
5
80
15
56
55
1
1
40
1.22
11646479--11646530
16
3.5
15
75
19
56
55
1
1
40
1.22
11651795--11651939
28
5.2
27
77
8
121
37
17
22
22
1.93
11651771--11651919
56
2.7
56
79
2
129
39
16
21
22
1.92
11651794--11651934
56
2.5
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140
37
17
22
21
1.94
11653702--11653823
34
3.6
34
77
8
126
40
13
9
35
1.78
11654638--11654700
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2.1
30
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0
117
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2
15.5
2
93
0
53
48
0
0
51
1.00
11667945--11667991
23
2.0
23
88
8
69
63
2
2
31
1.18

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378