Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr01 113035596 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  113035596

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  40  of  378  ( 45343 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
9869028--9869147
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0.72
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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19
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3.5
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0
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0
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3
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1.04
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0
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22
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1.95
9991883--9992022
54
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185
18
22
22
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0
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0
0
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2.4
125
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1
419
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14
18
39
1.89
10017899--10018242
125
2.7
126
83
2
370
27
15
18
39
1.90
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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3
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2
0
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4
4
57
1.41
10026681--10026716
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3.0
12
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41
1.77
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200
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14
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1.94
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1.95
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19
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1.95
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220
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20
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2.3
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19
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6
97
59
36
0
3
1.16
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
10038364--10038404
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19
22
22
1.96
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44
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23
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19
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1.96
10039800--10040162
175
2.1
172
85
4
480
35
19
23
22
1.96
10040404--10040449
24
1.9
24
95
0
83
26
50
2
21
1.60
10041707--10042009
125
2.4
125
88
0
444
26
14
19
39
1.90
10042498--10042547
26
1.9
26
91
0
82
40
2
14
44
1.56
10044733--10044783
24
2.1
24
100
0
102
39
19
5
35
1.76
10046183--10046214
12
2.6
13
90
9
50
46
18
12
21
1.82
10049990--10050103
56
2.0
58
86
3
160
45
5
20
28
1.72
10060334--10060384
22
2.2
23
89
10
77
19
3
5
70
1.24
10061799--10061835
5
7.6
5
87
6
58
18
0
2
78
0.87
10066302--10066345
18
2.5
17
79
13
54
75
2
2
20
1.03
10075298--10075373
22
3.3
22
67
22
66
31
13
30
25
1.93
10075273--10075464
47
4.1
47
91
1
298
32
11
29
26
1.92
10075347--10075422
23
3.2
25
62
24
63
28
13
34
23
1.92
10075423--10075569
50
3.0
50
93
3
244
37
8
24
29
1.84
10075719--10075819
37
2.7
37
95
0
175
22
20
30
25
1.98
10077290--10077338
20
2.5
20
96
0
89
28
26
18
26
1.98
10078097--10078140
20
2.4
18
88
11
63
0
34
0
65
0.93
10078190--10078319
3
44.7
3
81
9
162
35
3
0
61
1.12
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
10088349--10088415
34
2.0
34
100
0
134
44
5
10
38
1.63
10093121--10093172
20
2.5
20
87
3
77
25
13
11
50
1.75
10096317--10096380
30
2.1
30
85
8
85
46
4
6
42
1.49
10097487--10097526
2
20.0
2
100
0
80
50
0
0
50
1.00
10097791--10097833
3
14.3
3
85
0
50
34
30
0
34
1.58
10103292--10103338
24
2.0
24
95
0
85
34
6
34
25
1.81
10104088--10104159
29
2.5
29
81
0
72
36
19
2
41
1.66
10108913--10108939
12
2.2
12
100
0
54
37
11
18
33
1.86
10108948--10109047
50
2.0
50
98
0
191
34
11
28
27
1.90
10111378--10111415
17
2.2
17
100
0
76
5
47
26
21
1.71
10112744--10112777
2
18.0
2
88
11
54
47
0
0
52
1.00
10113370--10113422
27
1.9
28
84
3
72
28
5
5
60
1.42
10115236--10115290
29
1.9
28
96
3
101
20
21
25
32
1.97
10117477--10117604
47
2.7
46
87
2
175
25
25
16
32
1.96
10120324--10120431
55
2.0
55
100
0
216
40
18
11
29
1.85
10121463--10121506
18
2.4
19
80
3
54
56
0
36
6
1.26
10122716--10122758
21
2.0
21
100
0
86
32
9
39
18
1.83
10128235--10128275
5
8.2
5
84
10
57
19
2
58
19
1.50
10135469--10135526
21
2.7
22
86
10
84
18
32
36
12
1.88
10137517--10137668
3
50.0
3
67
16
64
61
1
7
28
1.32
10137611--10137679
15
4.5
15
78
18
70
65
2
2
28
1.22
10137593--10137667
33
2.3
33
84
9
91
64
2
5
28
1.29
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
10137722--10137839
3
40.7
3
68
14
52
66
3
4
26
1.26
10137722--10137806
9
8.9
10
72
18
65
67
3
4
24
1.26
10137739--10137819
23
3.5
22
79
12
83
69
1
6
23
1.19
10137719--10137818
45
2.2
44
76
16
107
68
3
6
23
1.26
10138447--10138489
2
21.5
2
95
0
77
48
0
2
48
1.14
10139232--10139446
78
2.8
78
92
0
342
30
21
17
30
1.96
10139236--10139448
41
5.4
40
66
9
125
30
22
17
30
1.96
10139286--10139405
37
3.1
37
65
9
87
30
22
17
30
1.97
10141280--10141339
25
2.4
25
83
8
68
70
5
11
13
1.33
10141444--10141520
29
2.6
28
76
12
75
46
14
12
25
1.80

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378