Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09
Please cite: G. Benson, "Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences" Nucleic Acid Research(1999) Vol. 27, No. 2, pp. 573-580. Sequence: Chr01 113035596 Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000 Length: 113035596

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  13  of  378  ( 45343 repeats found )
Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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G
T
Entropy
(0-2)
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Indices
Period
Size
Copy
Number
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Indels
Score
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28
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0.73
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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Indices
Period
Size
Copy
Number
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Score
A
C
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Entropy
(0-2)
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6
9
19
1.45
3886193--3886382
64
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64
89
0
283
32
14
12
40
1.84
3886569--3886667
44
2.2
44
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12
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21
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89
1.8
89
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10
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29
17
22
30
1.97
3886891--3887540
263
2.5
262
84
2
800
30
18
23
27
1.97
3887603--3887877
148
1.9
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4
370
31
15
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28
1.96
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20
2.0
20
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0
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55
20
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2
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2
95
0
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48
2
0
48
1.14
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18
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19
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27
2
10
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1.42
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2.1
17
100
0
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5
5
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17
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2.0
64
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35
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17
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19
2.1
19
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0
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5
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7
57
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0
0
81
0.70
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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9
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0
0
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0
0
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0.70
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49
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23
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2.1
19
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2.1
16
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0
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0
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2.0
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0
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1.10
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0
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2.7
23
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10
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49
0
0
50
1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
3958651--3958704
22
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0
0
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1.00
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0
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50
0
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12
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4
0
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1.19
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7
0
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22
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176
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1.97
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2.0
132
98
0
506
25
23
19
31
1.98

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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