Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr01 113035596 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  113035596

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  4  of  378  ( 45343 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
1076791--1076950
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2.0
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0
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1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.1
27
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0
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10
45
1.70
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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G
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Entropy
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1.56
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
1277535--1277590
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5
3
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1.38
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98
2.4
100
92
2
391
38
4
2
54
1.36
1282281--1282739
16
29.0
16
66
17
133
46
14
2
37
1.57
1282277--1282407
46
2.8
46
90
3
199
46
13
1
38
1.53
1282324--1282469
64
2.3
64
91
3
235
45
14
1
39
1.53
1282387--1282706
46
6.8
46
89
4
478
45
14
2
37
1.59
1282268--1282515
110
2.3
110
91
2
394
45
14
2
37
1.56
1282547--1282642
30
3.5
30
69
24
102
46
13
3
36
1.59
1282608--1282678
21
3.2
21
67
21
63
47
12
4
35
1.61
1282277--1282707
97
4.4
97
76
13
454
46
13
2
37
1.58
1283689--1283747
31
1.9
31
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6
84
20
5
16
57
1.58
1286372--1286427
27
2.0
28
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46
1
7
44
1.41
1288272--1288307
13
2.8
13
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16
56
55
0
0
44
0.99
1288271--1288307
16
2.3
17
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9
51
56
0
0
43
0.99
1288272--1288309
10
3.9
10
82
3
51
57
0
0
42
0.98
1293929--1294003
30
2.5
29
72
6
78
34
18
1
45
1.58
1295369--1295476
44
2.4
44
87
3
144
29
23
13
33
1.93
1302756--1302863
44
2.4
44
87
3
144
29
23
13
33
1.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
1304793--1305114
163
2.0
164
83
3
416
21
13
22
42
1.88
1311081--1311118
20
1.9
20
84
10
51
44
5
0
50
1.24
1313657--1313683
7
3.9
7
100
0
54
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0
0
14
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1
25.0
1
100
0
50
100
0
0
0
0.00
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2.0
141
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2
420
35
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12
30
1.90
1326352--1326396
19
2.4
19
100
0
90
42
13
31
13
1.82
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6
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0
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15
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0
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24
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10
22
1.66
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3.1
15
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2
2
21
1.04
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2
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2
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0
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0
0
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2
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34
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15
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0
23
0
0.78
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14
4.0
14
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51
67
3
1
27
1.17
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17
1.9
17
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0
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6
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0
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1.90
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25
2.1
25
100
0
104
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19
11
50
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4.8
48
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10
220
21
19
29
29
1.98
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47
3.7
47
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8
228
22
19
29
29
1.98
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29
3.1
26
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14
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27
3
5
63
1.34
1376645--1376718
31
2.4
31
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0
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41
9
21
27
1.84
1376781--1376823
8
5.4
8
94
0
50
53
0
0
46
1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
1376788--1376827
2
20.0
2
94
0
71
52
0
0
47
1.00
1377070--1377181
51
2.2
51
82
4
129
41
5
14
38
1.68
1379324--1379490
35
4.6
35
85
8
201
31
10
24
34
1.89
1379335--1379451
40
3.0
40
85
10
140
30
9
25
34
1.88
1379324--1379490
75
2.3
73
84
7
207
31
10
24
34
1.89
1381626--1381685
31
1.9
32
83
12
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40
6
5
48
1.51
1382014--1382072
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1.9
30
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10
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0
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0
0
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2
100
0
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50
0
0
50
1.00

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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