Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr01 113035596 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  113035596

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  35  of  378  ( 45343 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.6
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2
80
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2.0
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2.1
22
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4
2
21
1.14
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.3
75
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204
32
11
22
33
1.90
8857511--8857674
35
4.6
35
83
10
172
31
11
23
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1.9
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25
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2.3
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23
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2.0
24
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25
16
33
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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25
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2
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0
0
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1.33
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29
1.40
8898497--8898603
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2.1
51
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126
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4
29
1.40
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2.4
23
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5
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1.44
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14
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15
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1.95
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132
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133
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2
402
33
14
27
25
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
8908422--8908844
147
2.9
147
89
3
615
32
17
23
26
1.96
8908763--8908844
43
1.9
43
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0
119
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10
26
31
1.91
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177
2.3
176
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5
449
29
17
24
27
1.97
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18
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0
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0
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0
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0
0
51
1.00
8912261--8912313
14
3.5
15
78
14
63
16
1
5
75
1.08
8915458--8915504
24
1.9
24
86
4
67
27
2
0
70
0.99
8915479--8915534
15
3.9
15
74
6
53
21
1
0
76
0.87
8915454--8915506
21
2.7
21
77
16
60
26
1
0
71
0.96
8915454--8915525
20
3.7
21
77
18
77
25
2
0
72
0.98
8915479--8915550
36
2.0
37
83
8
94
20
4
1
73
1.07
8915556--8915598
17
2.6
17
79
17
54
20
6
2
69
1.23
8916669--8916714
23
2.0
22
87
4
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76
6
2
15
1.09
8918403--8918432
14
2.1
14
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0
51
40
0
13
46
1.43
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28
2.4
27
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10
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39
9
1
50
1.44
8921091--8921165
34
2.3
32
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49
17
0
33
1.47
8921468--8921515
22
2.1
22
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11
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0
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1.53
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22
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1.63
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2.0
22
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0
59
37
9
6
46
1.63
8939726--8940116
131
3.0
129
88
1
566
26
19
19
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1.96
8949186--8949359
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2.0
86
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0
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38
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5
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1.58
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14
1.9
14
100
0
54
37
14
11
37
1.82
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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25
2.6
25
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0
114
24
15
31
28
1.95
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16
2.7
16
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3
50
26
0
2
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0.98
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9
2.8
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0
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0
0
56
0.99
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8
4.1
8
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4
57
87
0
0
12
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0
0
53
1.00
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0
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2.1
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0
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27
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1.92
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1.9
21
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53
40
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20
20
1.92
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2.0
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11
2
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20
2.0
20
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0
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0
2
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27
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5
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1.44
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143
2.0
143
99
0
571
43
6
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1.68
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10
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28
1
1
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1.12
8977303--8977351
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2.6
19
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2
2
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0
0
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2
0
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1.12
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3.7
206
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0
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21
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2
20.5
2
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0
0
50
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15
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0
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1.19
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3
11.0
3
93
0
57
0
30
0
69
0.88
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
9002610--9002663
27
2.0
27
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0
99
27
25
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9005236--9005294
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2.2
26
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0
5
35
1.20
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30
0
0
69
0.88
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2.8
22
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7
70
23
0
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1.12
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28
0
3
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0
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1.9
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0
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15
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14
50
75
2
0
21
0.92

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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