Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr01 113035596 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  113035596

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  314  of  378  ( 45343 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
95582972--95583098
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2.1
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12
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4
20
1.25
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
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18
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2.3
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35
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24
1.80
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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28
2.1
27
83
9
71
26
8
8
56
1.59
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
95715798--95716024
47
4.9
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21
20
29
28
1.98
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47
3.7
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246
21
20
30
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1.98
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21
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19
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9
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51
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46
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22
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23
2
2
72
1.08
95729687--95729734
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4.5
10
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2
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2.0
19
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0
0
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95736466--95736503
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19
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0.40
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0
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42
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95748664--95748695
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2.1
16
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56
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112
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15
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95748753--95749303
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2.4
223
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17
100
0
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11
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1.86
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
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G
T
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2
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20
6
30
1.78
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
95815844--95816005
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3.8
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24
2.00
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5.1
40
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33
21
28
16
1.95

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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