Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr01 113035596 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  113035596

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
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This is table  207  of  378  ( 45343 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
61142899--61142934
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2.0
18
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0
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11
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48
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1
551
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5
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30
1.80
61146864--61147213
191
1.8
191
91
1
576
37
5
26
30
1.80
61147357--61147456
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2.7
37
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0
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1.96
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7.0
40
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0
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21
21
30
26
1.98
61149187--61149239
25
2.1
25
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39
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20
1.89
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3.5
28
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112
29
25
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29
1.96
61165689--61165787
28
3.5
28
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9
112
29
25
16
29
1.96
61168659--61168757
28
3.5
28
81
9
112
29
25
16
29
1.96
61176325--61176423
28
3.5
28
81
9
112
29
25
16
29
1.96
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23
2.7
22
82
5
84
25
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2.6
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17
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2.0
16
100
0
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6
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3.7
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2
88
29
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1.92
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48
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1.59
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3.2
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1.60
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0
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0
0
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0.90
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184
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1.91
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2.1
21
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0
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26
6
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2.0
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1.65
61199058--61199083
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3.2
8
100
0
52
26
11
0
61
1.30
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.0
24
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0
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21
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42
1.81
61199453--61199506
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19
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10
56
46
0
1
51
1.11
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25
3.2
25
76
10
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45
0
3
50
1.20
61199458--61199566
47
2.4
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89
4
168
46
0
2
50
1.15
61199452--61199571
20
5.7
20
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15
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47
0
2
50
1.14
61199846--61199928
9
9.2
9
89
0
112
45
25
0
28
1.54
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18
6.8
18
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6
131
46
22
0
31
1.52
61199846--61199964
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4.5
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136
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22
0
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1.52
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2.6
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0
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26
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3.1
42
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20
114
33
13
26
27
1.94
61213667--61213695
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2.1
14
93
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34
0
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1.9
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0
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2.5
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25
22
24
2.00
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3.5
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2
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36
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27
1.92
61237085--61237148
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2.1
31
96
0
119
23
21
15
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24
6.0
24
90
5
200
26
22
21
28
1.99
61237340--61237480
47
3.0
48
89
6
198
26
22
21
28
1.99
61237339--61237481
71
2.0
71
87
5
209
26
22
21
29
1.99
61237532--61237591
20
3.0
20
92
0
102
31
21
11
35
1.90
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25
1.9
25
86
0
69
25
16
25
33
1.96
61245163--61245271
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3.6
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9
150
21
24
17
36
1.94
61245463--61245581
24
5.0
24
89
5
170
26
22
21
28
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.5
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170
26
22
21
28
1.99
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18
3.0
19
92
5
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29
22
12
35
1.91
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25
1.9
25
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0
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25
16
25
33
1.96
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24
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17
74
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6
0
36
1.25
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3.0
22
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0
19
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2.0
46
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0
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1.66
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318
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23
23
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1.94
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6.1
41
86
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151
18
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22
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2.1
13
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0
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4
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24
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209
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22
22
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1.99
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207
26
22
22
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1.99
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22
21
28
1.99
61258422--61258540
47
2.5
48
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170
26
22
21
28
1.99
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20
3.0
20
92
0
102
31
21
11
35
1.90
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
61258693--61258740
25
1.9
25
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25
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25
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1.96
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33
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28
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106
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27
12
28
1.93
61271079--61271150
36
2.0
35
97
2
135
50
25
2
22
1.63
61271441--61271598
44
3.7
43
73
11
144
31
24
16
27
1.96
61271441--61271598
43
3.7
44
73
8
128
31
24
16
27
1.96
61274107--61274297
40
4.8
39
78
7
172
23
28
24
24
1.99
61274147--61274297
78
1.9
80
85
5
209
23
28
23
25
1.99
61278012--61278231
46
4.7
44
72
14
140
30
20
25
24
1.98
61279893--61280084
48
4.0
48
88
1
278
28
29
16
26
1.97
61279893--61280084
95
2.0
96
89
1
296
28
29
16
26
1.97
61285149--61285312
71
2.3
71
95
0
292
18
28
18
34
1.95
61285149--61285346
71
2.8
70
88
3
231
20
28
18
33
1.96
61287515--61287563
24
2.0
24
100
0
98
24
20
32
22
1.98
61288277--61288303
2
13.5
2
100
0
54
51
0
0
48
1.00
61293234--61293320
28
3.1
28
88
3
120
27
12
27
32
1.93
61299653--61300003
49
7.3
49
94
1
563
31
8
30
29
1.87
61302099--61302133
2
18.0
2
94
5
63
48
0
0
51
1.00
61303037--61303084
15
3.3
15
80
14
55
22
4
22
50
1.67
61324666--61324795
40
3.2
40
82
4
165
23
24
28
23
2.00
61332720--61332849
40
3.2
40
82
4
165
23
24
28
23
2.00
61335323--61335364
20
2.1
20
100
0
84
45
9
4
40
1.58
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
61343595--61343621
13
2.1
13
100
0
54
37
0
7
55
1.28
61349011--61349120
40
2.8
40
85
0
148
23
26
23
26
2.00
61357056--61357165
40
2.8
40
85
0
148
23
26
23
26
2.00
61364302--61364361
30
2.0
30
100
0
120
60
13
6
20
1.55
61370515--61370552
16
2.4
16
95
0
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47
18
26
7
1.76
61370768--61370845
29
2.8
28
75
7
77
24
14
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29
1.94
61381330--61381363
17
2.0
17
94
0
59
35
14
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1.77
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30
2.0
30
100
0
122
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9
6
29
1.59
61382567--61382591
10
2.5
10
100
0
50
60
0
0
40
0.97
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24
2.4
24
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5
80
25
23
14
37
1.92
61413513--61413775
39
6.7
39
93
0
436
29
28
21
20
1.98
61415842--61415923
24
3.6
24
84
15
129
34
25
18
21
1.96
61415849--61415913
19
3.1
20
80
20
87
35
23
18
23
1.96
61423946--61424062
46
2.7
43
82
13
118
29
17
28
23
1.97
61423990--61424110
46
2.7
44
85
7
145
28
18
28
24
1.98
61424080--61424209
49
2.6
50
83
6
167
26
16
30
26
1.97
61426873--61426913
21
2.0
21
100
0
82
43
21
9
24
1.83
61426907--61426937
10
3.1
10
95
0
53
25
12
29
32
1.93
61429476--61429661
40
4.7
40
86
5
227
25
21
26
26
1.99
61435160--61435327
40
4.2
40
80
3
187
25
22
26
25
2.00
61443174--61443320
40
3.7
40
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3
170
25
21
27
24
1.99
61444942--61445124
38
4.7
40
87
2
196
24
31
21
23
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
61444972--61445132
38
4.2
39
91
3
245
24
31
19
23
1.98
61444975--61445121
77
1.9
77
92
2
251
24
30
20
24
1.98
61448294--61448473
39
4.6
40
82
7
217
25
23
25
25
2.00
61448294--61448508
78
2.8
78
82
6
217
24
23
26
25
2.00
61457576--61457610
15
2.2
16
90
5
54
8
34
0
57
1.29
61465208--61465243
17
2.1
17
100
0
72
30
11
16
41
1.83
61466655--61466786
47
2.8
47
85
0
183
34
28
15
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1.94
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1.8
93
96
0
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27
29
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20
1.98
61468833--61469008
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3.8
46
80
12
225
28
28
21
21
1.98
61471384--61471452
30
2.3
30
85
7
97
59
17
14
8
1.60

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
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          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378