Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr01 113035596 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  113035596

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  330  of  378  ( 45343 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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Period
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Copy
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1.80
Indices
Period
Size
Copy
Number
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Score
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Entropy
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0
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1.48
Indices
Period
Size
Copy
Number
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Size
Percent
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Percent
Indels
Score
A
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(0-2)
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26
4.2
26
92
0
189
37
25
6
31
1.81
100471452--100471518
29
2.3
28
92
2
107
38
4
16
40
1.69
100471463--100471518
14
3.9
14
90
4
94
37
5
19
37
1.75
100471919--100472044
46
2.7
46
92
0
198
43
21
7
27
1.78
100471954--100472028
24
3.2
24
68
21
68
45
22
8
24
1.79
100472995--100473055
32
1.9
32
93
0
104
49
18
4
27
1.68
100472995--100473068
32
2.5
30
85
10
91
50
18
4
27
1.65
100476126--100476253
64
2.0
64
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0
238
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10
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16
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100492330--100492887
49
11.4
49
96
0
999
30
7
30
31
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100492516--100492598
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1.79
100492663--100492745
27
3.3
27
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22
70
31
3
30
34
1.75
100494881--100495231
40
8.8
40
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0
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25
21
27
25
1.99
100494888--100495247
199
1.8
199
95
0
648
24
21
28
25
1.99
100499014--100499540
49
10.8
49
95
0
919
30
8
30
30
1.87
100499200--100499282
27
3.3
27
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30
33
1.79
100522363--100522393
13
2.4
13
94
0
53
3
16
0
80
0.83
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12
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0
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0
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0.40
100532050--100532460
46
9.0
46
91
2
603
41
13
23
22
1.89
100532741--100532773
17
2.0
17
88
5
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48
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1.60
100537652--100537859
40
5.2
40
81
1
175
22
25
24
27
1.99
100537678--100537859
80
2.3
80
82
0
211
22
25
23
28
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
100540680--100540778
28
3.5
28
87
4
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27
15
27
30
1.96
100542927--100543017
17
5.4
17
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25
59
39
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3
51
1.41
100542996--100543112
62
1.9
59
87
5
171
41
4
4
49
1.42
100544421--100544494
36
2.1
36
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0
139
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2.5
25
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33
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25
22
1.96
100550777--100550834
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1.9
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13
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5
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1.39
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1.57
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18
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0
0
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7.0
46
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20
1.91
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137
2.3
138
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39
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24
20
1.91
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3
13
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78
1.03
100567552--100567599
24
2.1
22
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7
60
41
8
0
50
1.33
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19
3.6
19
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100568101--100568245
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2.0
73
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1
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27
8
8
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1.58
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15
2.3
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0
14
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0
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2.7
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11
275
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6
42
1.54
100587020--100587075
20
2.6
22
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3
48
1.37
100587819--100587871
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2.3
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0
3
47
1.19
100587932--100588026
49
1.9
49
95
0
172
22
4
10
63
1.43
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
100588433--100588581
77
1.9
78
86
6
214
26
6
9
58
1.52
100589146--100589184
17
2.3
17
82
8
53
35
2
0
61
1.10
100589165--100589207
10
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2
0
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1.10
100589220--100589254
11
3.2
11
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0
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0
0
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0.97
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0
0
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1
1
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0
0
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2.3
21
85
3
60
55
0
2
42
1.12

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378