Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr01 113035596 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  113035596

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  19  of  378  ( 45343 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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22
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5127062--5127471
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233
20
23
22
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5127556--5127751
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3.0
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Indices
Period
Size
Copy
Number
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Indels
Score
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Entropy
(0-2)
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232
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25
26
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Indels
Score
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1.90
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
5288370--5288416
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0
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19
15
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1.92
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130
1.8
129
86
4
347
38
19
15
26
1.91
5310053--5310293
3
81.0
3
67
14
97
62
3
7
26
1.40
5310077--5310120
23
1.9
23
90
0
70
56
2
6
34
1.38
5310057--5310129
23
3.6
20
75
13
60
60
2
6
30
1.37
5310074--5310130
23
2.5
23
79
0
69
59
3
5
31
1.36
5311121--5311160
12
3.5
11
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10
53
2
15
22
60
1.47
5312864--5313036
47
3.7
47
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13
194
21
19
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28
1.98
5312869--5313082
93
2.3
92
93
0
365
21
20
30
28
1.98
5312916--5313089
45
3.8
45
74
12
183
20
20
30
28
1.98
5321093--5321176
22
3.7
21
68
20
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5
34
1.46
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27
2.0
27
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0
92
0
34
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1.58
5325866--5325932
29
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1
5
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2
25.0
2
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2
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1.33
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36
2.4
37
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7
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38
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3
50
1.48
5331146--5331184
18
2.3
17
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8
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66
0
0
33
0.92
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18
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17
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47
0
0
52
1.00
5331260--5331305
7
6.9
7
90
9
78
43
15
15
26
1.85
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.0
19
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0
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15
15
26
1.87
5331254--5331305
26
2.0
26
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0
95
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13
15
26
1.84
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2
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2
100
0
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0
0
48
1.00
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20
1.9
20
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58
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2
10
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1.37
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60
0
0
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79
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2.1
19
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0
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1.68
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2.3
132
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34
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132
2.1
134
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36
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1.9
40
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0
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1.93
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0
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3.0
19
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3.2
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0
28
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21
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0
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26
2.1
25
85
7
70
55
5
3
34
1.42
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
5418973--5419020
25
2.0
24
88
12
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4
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29
1.40
5419266--5419386
24
4.9
24
69
15
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55
4
4
34
1.43
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22
2.5
22
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11
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61
0
3
35
1.13
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60
0
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1.39
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2.2
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0
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1.21
5421314--5421372
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0
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1.10
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23
2.0
23
91
4
74
24
6
0
68
1.13

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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