Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr01 113035596 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  113035596

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  285  of  378  ( 45343 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
85945572--85945615
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0
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2.0
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0
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5
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1.22
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2.0
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2.0
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2.0
44
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23
6.1
23
88
3
196
29
22
20
27
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.8
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20
1.98
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29
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20
1.98
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93
1.8
93
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0
317
27
29
21
20
1.98
86025732--86025904
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210
28
28
21
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1.98
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25
16
32
25
1.96
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29
2.6
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105
25
16
32
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1.96
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1.9
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100
0
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28
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3.0
30
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29
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1.98
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1.8
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29
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29
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1.98
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0.88
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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G
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Entropy
(0-2)
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13
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0
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2.0
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100
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100
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28
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1.9
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2.0
20
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2
69
1.01
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.0
23
84
12
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10
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36
1.65
86110350--86110394
23
2.0
23
82
8
56
40
13
8
37
1.76
86114049--86114100
25
2.1
25
100
0
104
19
38
13
28
1.89
86115881--86115915
13
2.7
13
100
0
70
28
0
17
54
1.43
86117850--86118002
40
3.8
40
79
5
148
25
28
23
22
2.00
86125859--86126003
40
3.7
40
77
7
125
26
27
23
22
2.00
86130075--86130205
55
2.4
55
82
0
163
19
22
33
24
1.97
86136212--86136249
19
2.0
19
100
0
76
21
21
21
36
1.95
86137671--86137710
21
1.9
21
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0
53
57
12
2
27
1.48
86138683--86138745
29
2.2
29
82
0
72
26
33
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30
1.88
86138955--86138992
16
2.4
16
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0
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7
18
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1.70
86144453--86144551
30
3.3
30
100
0
198
24
34
23
18
1.96
86147203--86147233
12
2.5
13
94
5
55
32
16
0
51
1.44
86150964--86151134
93
1.8
93
93
2
299
28
28
21
21
1.98
86150959--86151131
46
3.7
47
80
13
214
29
27
20
21
1.98
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2
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48
0
0
51
1.00
86156896--86156968
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2.4
31
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4
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8
5
34
1.55
86158228--86158277
19
2.8
17
82
11
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36
10
18
36
1.84
86158249--86158306
22
2.7
21
86
7
80
34
3
18
43
1.68
86163361--86163405
19
2.5
17
80
13
63
44
4
17
33
1.69
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
86163376--86163420
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2.0
23
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4
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37
4
17
40
1.70
86163793--86163984
40
4.8
40
87
1
253
23
19
28
28
1.98
86165952--86166134
79
2.3
81
84
7
232
25
27
22
24
2.00
86165931--86166134
40
5.1
40
82
7
236
25
28
22
24
1.99
86172802--86172933
29
4.6
29
83
1
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25
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16
25
1.96
86177802--86177988
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2.7
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5
281
18
28
18
34
1.95
86177825--86177988
71
2.3
71
100
0
328
18
28
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1.94
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71
2.8
70
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20
28
17
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1.95
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71
2.3
71
97
0
310
18
28
18
34
1.95
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71
2.8
70
90
3
249
20
28
17
32
1.96
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29
4.6
29
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1
149
25
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25
1.96
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2.4
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117
33
7
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45
1.72
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33
2.8
32
81
9
93
32
9
13
44
1.76
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101
2.1
101
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297
30
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28
1.97
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23
4.2
23
68
16
67
34
19
21
24
1.97
86205613--86205651
20
2.0
20
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10
53
20
2
10
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1.33
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22
2.5
21
88
8
76
25
1
5
67
1.21
86205729--86205776
11
4.6
10
80
16
53
22
4
2
70
1.15
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40
3.5
40
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1
124
27
23
26
22
1.99
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40
3.2
39
84
6
152
24
22
27
25
2.00
86217053--86217194
40
3.5
40
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1
124
27
23
26
22
1.99
86217092--86217220
40
3.2
39
84
6
152
24
22
27
25
2.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
86221852--86221959
40
2.7
38
85
8
128
21
29
25
23
1.99
86221811--86221959
80
1.9
80
81
2
183
22
30
24
22
1.99
86226337--86226392
15
3.8
14
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13
51
12
17
17
51
1.75
86226334--86226396
30
2.1
30
85
11
85
14
15
15
53
1.72
86236070--86236143
37
2.0
37
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31
12
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31
1.92
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2.7
20
88
0
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11
20
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86236317--86236378
25
2.5
25
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14
14
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13
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24
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29
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1.96
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25
3.2
24
74
20
74
35
16
26
22
1.95

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378