Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr01 113035596 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  113035596

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  94  of  378  ( 45343 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
25519823--25519861
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25521815--25522005
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159
34
12
16
37
1.86
25521806--25522005
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0
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48
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26
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3.7
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246
28
29
20
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18
2.2
18
95
0
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28
41
23
7
1.82
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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38
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143
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3
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22
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4
0
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1.14
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15
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6
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2
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2.0
22
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0
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53
0
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2.7
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15
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27
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93
30
5
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62
1.27
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10
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2
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3.5
19
79
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80
35
0
1
62
1.05
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
25600363--25600443
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2.9
28
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2.1
17
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2.0
21
100
0
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23
1.92
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2.0
24
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25
2
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1.18
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0
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3.7
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26
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48
100
0
194
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14
12
36
1.84
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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23
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10
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1.97
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13
100
0
52
30
15
23
30
1.95
25651456--25651503
19
2.6
19
86
3
71
39
2
10
47
1.49
25661415--25661491
22
3.4
22
69
15
66
66
1
2
29
1.13
25662902--25662959
28
2.1
28
93
0
98
31
8
8
51
1.63
25669936--25669975
20
2.0
20
100
0
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15
25
20
1.90
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16
2.1
16
100
0
68
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17
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1.90
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14
2.1
14
93
0
51
53
16
0
30
1.44
25674925--25675050
44
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40
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11
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33
25
20
20
1.97
25678702--25678737
18
2.0
18
88
0
54
55
13
5
25
1.60
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2.9
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7
190
30
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23
1.96
25689259--25689283
2
12.5
2
100
0
50
48
0
0
52
1.00
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13
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13
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0
50
0
48
28
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7
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0
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0
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17
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18
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23
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1.55
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0
0
40
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5.8
19
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11
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42
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12
1.85
25708385--25708497
39
2.9
39
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4
120
41
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28
12
1.86
25712713--25712756
20
2.2
20
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0
79
13
25
31
29
1.94
25722209--25722406
71
2.8
70
92
3
294
33
17
28
20
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
25722275--25722392
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3.1
41
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28
98
32
17
28
21
1.96
25722243--25722406
71
2.3
71
100
0
328
35
17
28
18
1.94
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27
2.3
29
82
10
82
75
9
7
7
1.19
25744350--25744404
2
29.0
2
78
10
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1
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1.30
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1.9
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0
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0
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26
2.1
26
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1.73
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19
2.0
19
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5
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21
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64
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220
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132
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132
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19
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27
1.98
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2.8
262
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1
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29
19
23
27
1.98
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14.1
44
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11
337
30
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28
1.98
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227
2.6
227
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0
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1.98
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2
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1.34
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18
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29
87
0
178
27
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32
24
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29
5.6
29
87
0
178
27
15
32
24
1.95
25790762--25791080
43
7.5
43
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4
423
29
29
17
24
1.97
25790762--25791080
85
3.7
86
87
4
423
29
29
17
24
1.97
25791160--25791204
22
2.0
22
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35
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25796009--25796051
16
2.8
15
83
13
52
76
0
20
2
0.89
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
25796859--25796883
11
2.3
11
100
0
50
56
0
36
8
1.29
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21
2.2
21
88
0
67
42
34
4
19
1.70
25798296--25798431
21
6.4
21
67
8
78
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28
0
23
1.57
25798383--25798436
14
3.9
14
75
4
56
46
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1
25
1.63
25798786--25798881
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2.4
40
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0
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21
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29
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40
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0
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155
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23
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1.9
21
89
0
62
45
0
12
42
1.42

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378