Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr01 113035596 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  113035596

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  105  of  378  ( 45343 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
28949043--28949137
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23
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22
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2.00
28951566--28951823
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2.2
120
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360
22
23
28
25
2.00
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186
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0
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55
1.16
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0
0
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2.0
61
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5.0
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2.5
106
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1
301
27
24
12
34
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4.1
43
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1
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1.9
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25
24
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1
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28
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18
28
1.98
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27
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19
29
1.98
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40
5.2
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27
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20
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1.99
28978668--28978850
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4.7
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248
25
29
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1.99
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40
4.8
40
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278
24
29
22
23
1.99
28986653--28986857
78
2.6
78
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299
26
29
21
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1.99
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5.9
49
96
0
524
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29
1.87
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2.1
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2
100
0
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50
0
0
50
1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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0
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0
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0
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10
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16
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2.1
31
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0
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23
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37
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23
6.0
24
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182
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20
19
29
1.97
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20
3.3
20
93
0
116
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20
11
34
1.90
29012677--29012732
11
5.5
11
71
16
57
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1.89
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0
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1.00
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32
0
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1.20
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2.5
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47
0
21
30
1.51
29018266--29018314
23
2.1
24
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73
44
0
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2.2
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3
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36
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28
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2.3
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50
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2.0
23
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57
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34
1.28
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3.2
12
85
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55
0
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1.29
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15
1
41
1.56
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3.2
25
66
23
76
32
30
3
33
1.76
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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32
1.84
29048998--29049459
96
4.8
94
87
7
619
29
30
7
32
1.84
29048998--29049459
145
3.2
145
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792
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30
7
32
1.84
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7.1
43
96
0
542
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31
22
13
1.92
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5.2
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211
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27
22
24
2.00
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30
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32
1.84
29055632--29056093
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4.8
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87
7
619
29
30
7
32
1.84
29055632--29056093
145
3.2
145
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1
792
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30
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2.5
21
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1.97
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1.99
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80
81
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183
22
30
24
22
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
29105107--29105214
40
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38
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128
21
29
25
23
1.99
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22
1.98
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2.9
22
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83
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28
17
19
1.94
29110213--29110249
5
7.4
5
93
0
65
18
2
0
78
0.87
29111119--29111183
34
1.9
34
96
0
121
18
24
20
36
1.94
29112538--29112603
32
2.1
32
97
0
123
16
18
15
50
1.79
29141348--29141392
22
2.0
23
86
4
65
37
13
6
42
1.70
29141371--29141503
18
7.5
17
86
5
176
36
12
10
39
1.78
29141371--29141512
35
4.0
35
93
2
230
37
13
9
39
1.78
29143245--29143316
31
2.3
31
83
4
83
13
33
30
22
1.93
29150121--29150176
27
2.1
27
96
0
103
33
23
14
28
1.94
29153504--29154064
131
4.3
129
81
4
485
37
9
11
40
1.74
29153495--29154064
130
4.4
130
80
4
512
38
10
11
40
1.75
29154789--29154821
2
16.5
2
100
0
66
48
0
0
51
1.00
29158936--29158988
3
17.7
3
100
0
106
67
0
0
32
0.91
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2
15.5
2
93
0
53
48
0
0
51
1.00
29174586--29174625
16
2.5
16
100
0
80
45
17
10
27
1.80
29175950--29175985
2
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2
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0
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50
0
0
50
1.00
29177917--29177966
16
3.0
17
82
8
59
54
2
2
42
1.23
29180929--29180991
24
2.6
24
82
2
81
41
20
20
17
1.91
29184410--29184444
2
17.5
2
100
0
70
48
0
0
51
1.00
29187901--29187929
3
9.7
3
100
0
58
31
0
0
68
0.89
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
29195309--29195382
36
2.1
36
82
12
91
56
20
10
12
1.65
29196458--29196491
18
1.9
18
94
5
61
23
11
0
64
1.26
29199629--29199708
39
2.1
39
97
0
151
30
11
22
36
1.89
29212861--29212991
40
3.3
40
78
2
147
25
23
27
23
2.00
29216865--29217072
40
5.2
40
81
2
193
25
24
25
24
2.00
29216867--29217072
80
2.6
80
82
3
227
25
24
26
24
2.00
29220315--29220373
27
2.2
27
96
0
109
27
15
16
40
1.89
29221619--29221652
17
1.9
18
88
5
52
50
5
5
38
1.51
29229873--29229948
38
2.0
38
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0
116
25
21
17
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1.94
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7
4.6
7
100
0
64
31
0
53
15
1.43
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41
3.1
41
60
28
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32
17
28
21
1.96
29236160--29236323
71
2.3
71
100
0
328
35
17
28
18
1.94
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2
16.0
2
100
0
64
50
0
0
50
1.00
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26
3.2
26
98
0
155
37
26
4
30
1.77
29255212--29255267
26
2.2
26
100
0
112
35
26
7
30
1.83
29256815--29257047
128
1.8
128
82
3
299
29
18
16
35
1.93
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2
16.0
2
100
0
64
50
0
0
50
1.00
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52
3.8
52
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0
299
18
32
28
20
1.96
29261703--29261850
40
3.7
40
91
3
228
25
28
21
24
1.99
29263590--29263627
20
1.9
20
88
0
58
42
15
7
34
1.76
29264882--29264990
58
1.9
58
84
5
150
32
24
16
26
1.96
29292745--29293082
48
7.0
48
93
0
550
34
5
27
32
1.81
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
29293223--29293325
37
2.8
37
92
0
179
23
19
32
25
1.98
29295126--29295167
22
2.1
19
86
13
57
52
0
2
45
1.13
29297151--29297376
50
4.6
50
81
7
252
28
19
28
23
1.98
29297145--29297378
98
2.4
96
82
10
273
27
18
29
24
1.98
29302889--29302932
14
3.4
14
70
23
51
22
15
18
43
1.88
29302887--29302943
24
2.4
24
90
0
87
22
15
21
40
1.91
29302936--29303011
23
3.3
23
73
14
77
25
23
18
32
1.97
29303383--29303433
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2.0
26
84
3
68
64
3
0
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1.11
29303395--29303443
26
2.0
24
88
8
71
63
6
0
30
1.19
29305125--29305221
40
2.5
38
79
3
113
14
12
36
37
1.84

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
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          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
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          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378