Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr01 113035596 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  113035596

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  325  of  378  ( 45343 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
98762341--98762435
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0
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2.2
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206
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1.97
98781748--98782178
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130
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577
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24
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1.97
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2.0
175
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1.97
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3.5
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2
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0
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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21
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1.99
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17
2.8
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22
50
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18
22
34
1.96
98797799--98797965
40
4.2
40
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169
25
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98799879--98799976
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98799890--98799976
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16
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0
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23
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23
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149
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23
23
16
1.94
98841452--98841566
54
2.1
54
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169
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23
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2.0
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108
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98868850--98868960
59
1.9
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1
6
32
1.33
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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Entropy
(0-2)
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1.31
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1.30
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98894659--98894700
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1.89
Indices
Period
Size
Copy
Number
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Size
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A
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(0-2)
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17
2.2
17
86
9
51
50
0
0
50
1.00
98918708--98918765
18
3.2
18
75
4
62
51
1
0
46
1.11
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2
13.5
2
100
0
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51
0
0
48
1.00
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2
15.5
2
100
0
62
51
0
0
48
1.00
98923474--98923500
2
13.5
2
100
0
54
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0
48
0
1.00
98937277--98937390
57
2.0
58
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1
167
46
6
17
29
1.72
98942399--98942480
26
3.2
26
92
0
137
36
26
6
30
1.81
98948145--98948195
23
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23
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10
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58
3
0
37
1.16
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5.1
40
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4
196
26
22
27
24
1.99
98957085--98957288
80
2.5
80
78
1
221
26
22
27
24
1.99
98965215--98965373
40
4.1
40
77
10
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25
22
27
24
2.00
98965248--98965357
36
2.9
36
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28
23
26
21
1.99
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27
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0
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1.94
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23
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0
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1.78
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19
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18
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10
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7
0
26
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1.17
98981529--98981567
18
2.1
19
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4
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2
0
28
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1.02
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32
2.0
32
100
0
130
30
3
21
44
1.67
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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3.2
39
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0
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38
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4.4
40
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27
27
21
23
1.99
98997578--98997753
79
2.2
79
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225
27
27
21
23
1.99
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2.2
43
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0
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28
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2.3
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32
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1.46
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3.1
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233
30
7
2
58
1.40
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2.9
28
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32
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1.24
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28
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0
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0
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0
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1.83
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26
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100
0
112
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1.83
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26
2.2
26
100
0
112
35
26
7
30
1.83
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
99045194--99045253
26
2.4
24
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3
0
28
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22
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69
6
0
23
1.12
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44
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15
2.1
15
100
0
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6
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49
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0
196
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0
0
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31
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0
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41
18
23
16
1.90

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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