Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr01 113035596 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  113035596

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  157  of  378  ( 45343 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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3.5
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158
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26
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Indices
Period
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Copy
Number
Consensus
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Percent
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Percent
Indels
Score
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0
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0
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1.05
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Matches
Percent
Indels
Score
A
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Entropy
(0-2)
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1.22
Indices
Period
Size
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A
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(0-2)
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17
2.1
17
88
0
52
51
5
0
42
1.25
45647624--45647989
184
2.0
184
92
0
606
26
15
27
31
1.96
45651862--45651971
26
4.2
26
94
2
177
34
4
24
36
1.76
45653454--45653506
26
2.0
26
82
7
63
37
20
15
26
1.92
45653754--45654040
137
2.1
137
96
0
529
24
18
25
32
1.97
45659355--45659616
40
6.6
40
92
1
402
25
21
26
25
2.00
45682967--45683283
49
6.5
49
97
0
598
30
8
30
30
1.88
45683384--45683504
37
3.3
37
92
1
199
26
18
33
22
1.97
45691590--45691708
6
19.3
6
77
17
120
47
15
18
17
1.82
45691599--45691708
31
3.5
31
80
14
145
48
15
19
17
1.82
45691610--45691680
19
3.8
19
85
10
110
47
16
19
15
1.82
45691599--45691699
37
2.7
37
87
4
150
47
15
19
16
1.83
45691827--45691886
27
2.3
26
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2
66
35
21
21
21
1.96
45692155--45692378
27
8.3
27
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3
238
25
20
18
36
1.95
45692144--45692251
54
2.0
53
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5
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27
21
19
31
1.97
45692159--45692373
54
4.0
54
81
1
263
25
21
18
35
1.95
45692333--45692673
27
12.7
27
76
7
133
31
9
20
38
1.86
45692360--45692543
81
2.3
80
79
5
192
30
10
22
36
1.88
45692397--45692673
54
5.2
53
81
5
263
31
9
19
39
1.83
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
45692399--45692673
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3.4
81
80
5
263
31
9
19
39
1.83
45692468--45692673
107
1.9
108
89
3
317
32
8
19
40
1.81
45692469--45692673
27
7.6
27
84
4
245
31
8
19
40
1.81
45692479--45692689
80
2.6
80
83
3
219
33
8
18
39
1.80
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46
5.8
46
72
13
200
26
20
31
22
1.98
45694323--45694596
94
2.9
92
81
7
273
26
20
31
22
1.98
45702457--45702507
21
2.3
22
90
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35
21
0
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1.53
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43
2.7
43
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24
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1.97
45713731--45713771
20
2.0
20
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0
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19
19
1.96
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16
2.8
17
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6
60
47
13
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15
1.80
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25
2.2
25
90
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33
5
19
41
1.74
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3.8
46
80
12
225
20
20
29
29
1.98
45725953--45726124
93
1.8
93
97
0
326
20
20
29
28
1.98
45736613--45736687
36
2.1
36
97
0
141
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2
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41
1.65
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22
1.9
24
90
9
74
70
15
13
0
1.17
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21
2.3
21
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10
66
36
0
2
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1.07
45751424--45751488
34
2.0
34
81
6
80
32
24
15
27
1.95
45753287--45753394
26
4.2
26
93
0
189
36
24
7
32
1.83
45759331--45759438
26
4.2
26
90
0
171
37
23
6
33
1.80
45761408--45761480
27
2.7
27
100
0
146
31
12
27
28
1.93
45761408--45761554
27
5.5
26
89
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127
33
15
25
25
1.95
45764801--45764858
24
2.4
24
81
16
59
56
3
5
34
1.38
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
45770978--45771007
12
2.5
12
100
0
60
6
23
43
26
1.78
45775700--45775767
30
2.3
30
84
5
84
47
5
19
27
1.72
45777881--45778235
46
7.7
46
92
1
527
41
13
23
22
1.89
45778531--45778563
17
2.0
17
94
5
59
48
0
15
36
1.45
45784666--45784789
39
3.2
39
87
1
176
24
20
30
25
1.98
45784683--45784819
39
3.5
40
85
1
134
24
24
30
21
1.99
45789943--45789981
6
6.3
6
85
5
51
79
0
5
15
0.90
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93
95
0
310
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30
21
20
1.98
45797790--45797965
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3.8
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10
205
28
30
21
20
1.98
45797798--45797984
46
4.0
46
73
15
145
28
29
20
20
1.98

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378