Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr01 113035596 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  113035596

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  18  of  378  ( 45343 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
4877569--4877630
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4881029--4881084
14
4.0
14
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69
16
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37
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1.71
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2.2
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0
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39
1.17
4883108--4883186
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39
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0
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0
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144
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23
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152
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1.93
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2.9
84
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1
347
25
21
24
28
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
4918314--4918624
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25
21
24
28
1.99
4923933--4923980
21
2.3
21
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13
53
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2
1.58
4924219--4924301
31
2.6
31
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3
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15
4
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1.53
4924353--4924452
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2.3
43
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2.0
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268
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2.8
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2.0
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1.9
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23
11
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4971841--4972007
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35
4.6
35
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185
33
23
10
32
1.89
4979334--4979506
75
2.4
73
83
9
210
33
23
10
32
1.89
4985204--4985246
21
2.0
21
95
0
77
34
9
41
13
1.77
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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22
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0
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51
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10
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2
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1
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2.0
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2
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1.64
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12
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0
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15
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5.1
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23
21
17
1.94
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1.94
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22
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25
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45
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1.76
5005256--5005312
14
4.1
14
80
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19
0
36
43
1.51
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
5005251--5005415
21
7.9
21
65
10
70
23
0
35
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1.55
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13.3
7
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0
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37
1.56
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3.0
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15
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254
87
1
703
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18
13
29
1.90
5023421--5023502
29
2.9
29
88
1
121
56
1
10
31
1.42
5023484--5023550
31
2.2
30
80
12
75
52
0
8
38
1.33
5024333--5024366
9
3.7
9
88
7
50
5
5
0
88
0.64
5024873--5024933
31
2.0
31
86
0
86
1
13
16
68
1.28
5025623--5025870
88
2.8
89
86
3
288
26
21
20
31
1.98
5025668--5025958
44
6.6
44
76
3
253
26
24
20
28
1.99
5025666--5025870
88
2.3
88
91
0
338
26
22
21
29
1.99
5025746--5026016
133
2.0
133
89
0
416
26
24
19
29
1.99
5025668--5026002
44
7.6
43
71
9
185
26
23
20
28
1.99
5028923--5028956
17
2.0
17
100
0
68
29
11
17
41
1.85
5038275--5038356
29
2.9
29
94
1
139
54
1
12
31
1.45
5038297--5038346
15
3.4
15
73
15
59
56
0
14
30
1.39
5038598--5038636
3
13.0
3
100
0
78
66
0
0
33
0.92
5039458--5039493
18
2.0
18
89
10
56
0
25
2
72
0.98
5039718--5039778
31
2.0
31
83
0
77
0
16
16
67
1.24
5047546--5047653
57
1.9
57
81
3
130
25
15
24
34
1.95
5047612--5047768
43
3.7
43
81
3
210
24
17
28
29
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
5047921--5047951
16
1.9
16
93
0
53
41
6
16
35
1.74
5053232--5053318
6
15.0
6
70
17
60
20
2
0
77
0.89
5053236--5053315
3
27.7
3
72
16
53
21
2
0
76
0.91
5053236--5053316
18
4.5
19
88
11
109
20
2
0
76
0.90
5054402--5054581
99
1.8
98
88
5
274
32
13
23
30
1.93
5055970--5056004
18
1.9
18
94
0
61
25
8
5
60
1.49
5060703--5060730
2
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2
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0
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50
0
0
50
1.00
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2.0
30
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0
100
37
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5
40
1.71
5075965--5075995
13
2.4
13
94
0
53
41
6
0
51
1.27
5077195--5077235
18
2.3
18
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0
55
29
12
2
56
1.49
5079074--5079098
13
1.9
13
100
0
50
60
0
16
24
1.36
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87
2.9
87
84
4
327
36
20
21
22
1.95
5090195--5090448
43
5.9
43
78
8
264
36
20
21
22
1.95
5090248--5090494
130
1.9
130
90
3
399
36
21
21
21
1.95
5091934--5091974
18
2.3
18
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0
55
29
12
2
56
1.49
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13
2.0
13
100
0
52
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0
15
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1.33
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2.1
37
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134
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2
0
36
1.10
5102395--5102541
3
48.0
3
80
6
161
30
7
0
61
1.29
5102631--5102677
19
2.4
20
80
20
55
36
4
4
55
1.39
5108935--5108975
21
2.0
21
90
0
64
19
29
21
29
1.98
5112665--5112689
2
12.5
2
100
0
50
48
0
0
52
1.00
5114141--5114211
35
2.0
35
100
0
142
36
14
14
35
1.86
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
5115131--5115165
17
2.1
17
88
0
52
57
2
2
37
1.29
5115669--5115726
30
1.9
30
89
0
89
37
8
13
39
1.76
5115903--5116023
55
2.2
55
88
2
172
45
3
1
49
1.28
5121442--5121512
30
2.3
31
82
7
90
50
5
0
43
1.25
5122578--5122652
35
2.1
35
97
0
141
18
22
8
50
1.73
5124785--5124880
3
32.0
3
77
8
88
59
2
7
31
1.36
5124777--5124887
12
9.3
12
71
18
65
59
1
8
30
1.37
5124990--5125081
3
31.7
3
78
8
84
63
2
2
32
1.19
5125095--5125151
27
2.1
28
83
3
71
56
5
7
31
1.49
5125092--5125151
28
2.3
27
78
13
65
55
5
8
31
1.51

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378