Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr01 113035596 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  113035596

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  82  of  378  ( 45343 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
22171750--22171820
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0
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0
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166
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27
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3.8
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3
171
23
26
22
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1.99
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55
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2.0
21
90
0
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21
17
17
43
1.87
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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13
25
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3.5
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162
25
13
25
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1.93
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4.0
43
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15
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2.0
58
100
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24
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6
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1.50
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15
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5
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1.41
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16
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35
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1.93
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13
20
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2.6
12
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0
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58
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9
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1.31
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.0
16
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18
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1.75
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1.9
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1
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1.98
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78
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29
2.0
29
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24
40
15
19
1.90
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
22389951--22389982
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12
95
0
55
46
3
0
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0
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0
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28
30
1.76
22392861--22392896
18
2.0
18
100
0
72
38
16
11
33
1.84
22392903--22392980
40
2.0
40
94
0
138
33
19
6
41
1.77
22394856--22394913
17
3.6
17
71
21
61
62
0
1
36
1.06
22395195--22395303
20
5.6
19
76
17
100
57
0
6
34
1.30
22395246--22395304
7
8.7
7
73
26
56
57
1
3
37
1.25
22396899--22398472
205
7.7
205
94
0
2634
28
21
18
31
1.97
22400341--22400443
44
2.3
45
84
3
127
30
22
12
34
1.91
22400360--22400448
46
2.0
44
91
4
142
28
25
13
32
1.94
22409094--22409130
15
2.5
16
87
12
53
43
10
24
21
1.84
22412862--22412919
17
3.6
17
71
21
61
62
0
1
36
1.06
22413201--22413309
20
5.6
19
76
17
100
57
0
6
34
1.30
22413252--22413310
7
8.7
7
73
26
56
57
1
3
37
1.25
22413252--22413327
27
2.9
27
77
12
77
61
1
2
34
1.18
22419744--22419791
25
1.9
25
86
0
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33
25
16
25
1.96
22419835--22419893
20
3.0
20
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0
100
37
11
20
30
1.89
22419944--22420015
24
3.0
24
83
6
92
27
20
25
26
1.99
22420207--22420308
31
3.1
31
78
17
123
39
15
21
23
1.92
22420224--22420331
38
2.8
38
94
1
189
39
14
22
23
1.91
22426477--22426524
25
1.9
25
86
0
69
33
25
16
25
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
22426568--22426626
20
3.0
20
92
0
100
37
11
20
30
1.89
22426677--22426748
24
3.0
24
83
6
92
27
20
25
26
1.99
22426940--22427041
31
3.1
31
78
17
123
39
15
21
23
1.92
22426957--22427064
38
2.8
38
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1
189
39
14
22
23
1.91
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2.5
19
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19
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4
0
39
1.19
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2
19.5
2
100
0
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48
0
0
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1.00
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3.0
20
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20
20
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1.88
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12
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1.95
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16
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2.8
13
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0
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2
24
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1.9
30
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0
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1.93
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2.3
18
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5
5
25
1.34
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31
2.8
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31
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1.82
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1.9
60
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1.9
71
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0
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39
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1.89
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6
5.3
6
100
0
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0
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15
1.21
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12
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0
61
77
0
5
17
0.96
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18
2.0
18
94
0
63
75
0
8
16
1.04
22478378--22478412
6
5.8
6
89
0
52
77
0
5
17
0.96
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2.1
59
89
0
187
26
16
13
43
1.85
22485019--22485061
2
22.0
2
85
4
52
44
0
6
48
1.29
22485026--22485060
12
2.9
12
95
0
61
40
0
8
51
1.33
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
22485023--22485061
14
2.8
14
92
0
69
43
0
7
48
1.31
22485902--22485945
21
2.1
21
87
4
63
45
0
15
38
1.47
22489197--22489236
21
1.9
21
94
0
71
32
12
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37
1.87
22493828--22493917
44
2.1
43
87
2
126
50
10
11
28
1.70
22497455--22497530
37
2.1
37
100
0
152
42
15
13
28
1.85
22506457--22506501
21
2.1
21
95
0
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15
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1.63
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2.0
26
92
0
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1.63
22506634--22506694
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2.7
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1.71
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5
110
37
16
18
27
1.93
22512803--22512857
26
2.1
26
93
0
92
25
32
9
32
1.87

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378