Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr01 113035596 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  113035596

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  318  of  378  ( 45343 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.12
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Period
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Score
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96827617--96827723
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1.71
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Score
A
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(0-2)
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1.92
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Indices
Period
Size
Copy
Number
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Size
Percent
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Percent
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Score
A
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(0-2)
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1.9
259
91
2
752
21
32
17
27
1.96
96913768--96913797
6
5.0
6
91
0
51
3
33
13
50
1.58
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19
2.5
19
93
0
87
41
16
20
20
1.90
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24
2.2
24
83
6
65
38
16
24
20
1.92
96920756--96920793
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2.0
19
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0
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28
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2
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2
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0
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0
0
50
1.00
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25
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2
4
21
1.12
96927071--96927113
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18
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11
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11
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0
58
58
0
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34
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19
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1.60
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18
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7
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48
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0
0
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201
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7
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96948809--96948865
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52
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1.97
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20
22
27
1.99
96951890--96951987
19
5.2
19
90
7
155
37
10
17
34
1.83
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.83
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2
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21
26
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1.99
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0
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0
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25
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0
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1
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132
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1.96
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3.2
175
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1.96
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19
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1.96
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1.99
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28
28
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1.99
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10
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27
18
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30
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1.9
21
90
5
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60
2
2
34
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1.9
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13
3.1
13
92
0
71
15
35
32
17
1.91
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
97007848--97007892
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2.2
20
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0
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24
24
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24
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24
89
0
106
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2
35
26
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0
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24
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209
26
22
22
28
1.99
97009713--97009853
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3.0
48
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207
26
22
22
28
1.99
97009712--97009854
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2.0
71
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23
23
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6.0
24
91
4
209
26
22
22
28
1.99

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378