Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr01 113035596 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  113035596

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  337  of  378  ( 45343 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
102310283--102310371
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0
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2.9
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1.35
102310554--102310614
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2.9
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2.8
28
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2
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1.27
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
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(0-2)
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2.0
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17
93
0
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18
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60
1.54
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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16
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2.0
20
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1.98
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1.8
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91
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28
20
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1.98
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28
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1.9
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1.94
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85
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204
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1.9
133
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4
329
27
19
21
32
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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100
0
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37
15
1.88
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15
2.5
16
84
16
55
66
5
5
23
1.32
102434383--102434701
3
105.0
3
73
11
150
58
2
9
30
1.42
102434652--102434729
30
2.8
26
83
15
77
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1
5
28
1.22
102435268--102435327
26
2.4
24
83
8
75
68
3
0
28
1.05
102435298--102435356
21
2.8
22
85
7
70
69
6
0
23
1.12
102436582--102436646
20
3.1
20
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13
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41
0
4
53
1.21
102446365--102446603
3
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3
72
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159
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2
7
31
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102446765--102446938
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1
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102446770--102446796
14
1.9
14
100
0
54
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29
1.42
102450174--102450216
22
1.9
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102451716--102451937
50
4.7
47
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13
206
26
18
30
24
1.98
102451714--102451937
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96
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102455202--102455260
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22
1.31
102456398--102456452
25
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102456514--102456575
25
2.5
23
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1.44
102456562--102456636
29
2.5
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29
1.41
102456601--102456728
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4
35
1.36
102456671--102456729
22
2.7
22
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14
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3
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1.31
102457010--102457048
16
2.4
16
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0
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1.75
102457205--102457302
30
3.3
30
95
0
169
18
7
51
23
1.71
102457239--102457292
18
3.3
18
66
28
57
20
7
50
22
1.73
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.4
87
84
5
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36
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14
30
1.91
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1.8
103
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5
285
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15
28
1.89
102458240--102458449
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2.3
88
75
16
169
39
15
16
28
1.89
102458339--102458371
14
2.4
14
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0
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63
6
12
18
1.48
102458350--102458936
218
2.7
218
88
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33
19
16
30
1.94
102458350--102459022
145
4.5
148
83
8
728
34
19
16
30
1.94
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18
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2.0
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5
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102471337--102471546
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1.45
102472010--102472107
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3.3
30
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0
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18
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1.69
102472044--102472097
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22
1.73
102474843--102474914
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2.9
25
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0
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20
20
1
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2.0
24
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1.56
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1.67
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2.3
23
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102485514--102485553
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2.0
20
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0
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0.91
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2.0
17
88
5
50
51
18
6
24
1.68
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
102493731--102493768
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4.2
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0
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39
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1.52
102494583--102494613
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2.3
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0
0
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0
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2.1
19
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0
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10.0
6
79
7
57
79
3
5
12
1.02

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378