Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr01 113035596 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  113035596

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  209  of  378  ( 45343 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
61840731--61840848
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0
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1.94
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2.3
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1.94
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26
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1.98
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2.1
19
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2.7
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2.1
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100
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2.6
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2.9
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0
52
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76
0
11
1.01
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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20
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19
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1.98
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21
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1.94
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30
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1.97
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29
3.2
29
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25
27
15
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1.96
61929623--61929753
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2.3
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25
32
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2.2
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14
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0
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2.0
20
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25
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4.5
45
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1.94
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19
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143
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10
16
35
1.84
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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27
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1.99
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2.0
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28
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0
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0
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1.96
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30
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99
10
17
15
56
1.66
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
62019002--62019130
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29
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39
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0
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88
2
226
21
25
19
32
1.97
62039030--62039081
26
2.0
26
96
0
95
34
21
11
32
1.89
62040227--62040404
42
4.3
42
86
2
216
22
19
21
35
1.96
62040227--62040404
82
2.1
83
83
2
214
22
19
21
35
1.96
62045489--62045715
48
4.7
48
89
4
307
24
17
29
27
1.97
62052896--62053093
51
3.9
51
93
1
335
28
24
14
32
1.94
62053118--62053240
52
2.4
52
89
5
194
26
24
13
35
1.93
62053118--62053240
24
4.7
27
79
15
150
26
24
13
35
1.93
62062969--62063099
3
44.0
3
93
1
201
29
0
4
66
1.11
62063811--62063851
13
3.0
14
79
13
50
39
2
9
48
1.49
62066582--62066693
29
3.9
29
73
5
84
26
29
15
28
1.96
62066916--62066974
24
2.5
24
80
0
64
10
20
18
50
1.75
62076076--62076109
17
1.9
17
88
5
50
73
0
2
23
0.97
62076079--62076121
21
2.0
23
86
9
63
72
2
2
23
1.08
62077037--62077079
20
2.1
21
86
4
61
65
6
0
27
1.18
62077520--62077568
20
2.5
20
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0
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51
8
8
32
1.61
62088925--62089143
93
2.3
95
80
4
228
25
27
19
27
1.99
62088921--62089190
49
5.7
49
77
7
207
24
27
20
27
1.99
62088971--62089282
49
6.6
47
78
8
219
22
28
21
27
1.99
62089110--62089282
46
3.7
45
77
12
163
20
28
22
28
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
62091394--62091466
28
2.6
28
93
0
119
32
24
10
31
1.90
62091453--62091546
28
3.4
28
72
7
84
35
22
10
31
1.88
62091571--62091642
22
3.2
22
75
7
72
29
31
13
25
1.94
62091578--62091643
24
2.9
23
72
14
57
31
31
13
22
1.93
62091700--62091850
57
2.6
57
89
1
221
35
27
9
26
1.88
62095140--62095389
40
6.2
40
90
1
385
25
24
28
22
1.99
62103315--62103564
40
6.2
40
90
1
385
25
24
28
22
1.99
62113298--62113366
35
1.9
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26
21
15
36
1.94
62113792--62113915
28
4.4
29
76
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103
29
23
13
33
1.93
62113899--62113959
28
2.2
28
82
5
70
26
18
16
39
1.91
62117583--62117979
50
7.9
50
79
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384
26
17
25
30
1.97
62117591--62118011
152
2.8
150
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3
344
26
16
26
30
1.97
62120994--62121036
21
2.0
21
100
0
86
37
13
4
44
1.65
62126474--62126517
16
2.8
17
80
13
58
81
0
2
15
0.78
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24
3.6
25
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18
73
69
0
4
26
1.07
62126474--62126543
33
2.1
33
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10
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72
0
4
22
1.01
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27
2.8
27
76
7
73
26
5
3
64
1.32
62126823--62126886
26
2.5
26
78
19
71
26
1
7
64
1.30
62130394--62130422
5
5.8
5
100
0
58
82
0
0
17
0.66
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35
1.9
33
84
12
87
38
1
3
56
1.24
62130832--62130881
25
2.0
25
88
0
73
32
0
8
60
1.26
62134461--62134501
21
2.0
21
90
0
64
29
21
29
19
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
62141149--62141176
12
2.3
12
100
0
56
64
10
17
7
1.47
62150287--62150358
29
2.4
30
83
6
92
22
29
26
22
1.99
62150463--62150532
15
4.7
15
75
13
56
24
25
27
22
2.00
62152709--62152751
20
2.3
19
84
11
54
16
34
30
18
1.93
62153393--62153480
42
2.1
42
95
2
160
26
25
19
29
1.98
62154521--62154713
48
4.0
48
76
2
181
27
27
18
25
1.98
62159498--62159659
39
4.1
39
89
0
234
24
19
31
25
1.98
62159498--62159689
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0
222
23
20
31
24
1.98
62169634--62169817
79
2.3
81
83
8
227
24
22
27
25
2.00
62169634--62169817
40
4.7
40
78
8
189
24
22
27
25
2.00

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378