Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr01 113035596 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  113035596

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  139  of  378  ( 45343 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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T
Entropy
(0-2)
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Period
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Score
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(0-2)
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Indices
Period
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Number
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A
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(0-2)
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72
2.0
72
87
2
207
21
37
15
25
1.93
39775967--39776119
39
3.9
39
92
0
243
24
20
31
23
1.98
39775968--39776150
39
4.6
39
88
0
240
24
22
30
22
1.99
39775974--39776188
78
2.7
79
81
5
177
25
22
30
22
1.99
39779577--39779605
12
2.4
12
100
0
58
27
34
31
6
1.83
39779630--39779684
24
2.3
24
100
0
110
18
23
12
45
1.83
39794705--39794888
40
4.6
40
82
4
174
28
22
26
23
1.99
39794747--39794933
80
2.3
80
79
3
189
24
22
29
24
1.99
39797615--39797690
31
2.5
31
84
0
107
19
32
30
17
1.95
39800845--39800889
20
2.2
20
88
7
65
73
0
24
2
0.95
39800859--39800893
12
2.8
13
86
8
54
74
0
25
0
0.82
39801959--39802278
10
33.1
9
63
23
68
57
5
4
32
1.42
39802050--39802127
9
7.7
10
71
15
54
61
3
2
32
1.27
39802219--39802253
18
1.9
18
88
0
52
57
0
2
40
1.14
39804122--39804377
144
1.8
140
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6
376
42
3
17
37
1.66
39808879--39808905
13
2.1
13
100
0
54
33
7
51
7
1.58
39819712--39819742
2
15.5
2
100
0
62
51
0
0
48
1.00
39849431--39849653
10
23.3
9
68
20
107
31
1
4
62
1.24
39849581--39849648
17
3.8
17
74
16
66
23
1
4
70
1.13
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
39856046--39856155
26
4.2
26
97
0
184
33
5
24
36
1.79
39857595--39857669
26
2.8
26
83
4
78
34
21
12
32
1.90
39857773--39857885
27
4.2
27
85
3
129
16
23
23
36
1.94
39857771--39857885
54
2.1
54
88
3
169
16
23
23
36
1.94
39860919--39860962
9
4.9
9
91
0
70
45
15
11
27
1.81
39860919--39860970
27
1.9
27
88
0
77
46
17
11
25
1.81
39860916--39860962
18
2.6
18
100
0
94
46
14
10
27
1.78
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5
6.2
5
92
0
53
19
19
16
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1.86
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24
2.0
24
95
0
85
14
21
21
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1.88
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28
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7
91
20
16
33
29
1.94
39882216--39882316
29
3.6
28
78
7
98
20
16
33
28
1.95
39882246--39882323
27
2.8
27
80
7
77
21
15
33
29
1.94
39884782--39884862
31
2.6
32
78
2
83
61
18
3
16
1.48
39891842--39891891
11
4.4
11
80
9
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38
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40
1.75
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18
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19
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25
2
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1.63
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2
15.0
2
100
0
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0
0
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21
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68
21
0
24
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14
2.3
14
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55
12
0
25
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28
2.4
28
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7
84
25
0
23
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4
417
25
18
22
33
1.96
39894702--39895159
81
5.6
80
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434
25
17
22
34
1.96
39900412--39900461
20
2.5
20
86
3
64
50
2
12
36
1.51
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
39906108--39906428
161
2.0
161
95
0
570
27
10
17
44
1.81
39913471--39913502
16
2.0
16
93
0
55
21
0
3
75
0.95
39914117--39914282
7
22.7
7
69
11
75
40
36
2
20
1.66
39914243--39914277
15
2.4
15
90
4
54
45
34
0
20
1.51
39914315--39914395
41
2.0
41
97
0
153
19
25
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30
1.98
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40
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22
22
22
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1.98
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3.2
23
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0
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30
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47
4
8
39
1.55
39927951--39928084
61
2.2
59
81
9
153
49
5
8
37
1.55

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378