Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr01 113035596 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  113035596

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  50  of  378  ( 45343 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
12486718--12486802
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1.98
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4.4
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4
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30
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1.98
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2.0
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2.1
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0
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50
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17
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0
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0
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1.98
12526455--12526572
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1.9
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18
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1.98
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2
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0
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19
1.9
19
88
0
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2
5
21
1.20
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.9
18
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2
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0
50
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1
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1.26
12551625--12551682
30
1.9
30
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91
67
1
8
22
1.27
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46
4.9
46
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41
12
22
23
1.88
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17
2.0
17
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51
0
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0
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2.5
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19
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63
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0
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15
2.1
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33
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1.77
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1
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2.1
22
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30
2
4
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1.26
12603637--12603895
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18
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2
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5.9
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20
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0
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0.95
12606640--12606701
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4.7
13
84
9
81
24
1
0
74
0.91
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2
0
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0.90
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2.6
23
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68
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0
3
57
1.15
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42
0
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55
1.14
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19
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14
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42
0
1
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1.09
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0
0
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1.00
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0
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1.00
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22
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7
53
62
2
0
35
1.07
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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20
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0
38
1.20
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3
40
1.38
12614185--12614238
22
2.4
23
82
11
67
51
1
0
46
1.11
12614201--12614312
34
3.1
36
78
13
131
58
2
0
38
1.12
12614214--12614254
15
2.8
15
92
3
66
60
4
0
34
1.18
12614234--12614274
22
1.9
21
95
5
73
58
4
0
36
1.20
12614233--12614274
21
2.0
21
90
9
59
59
4
0
35
1.19
12614266--12614313
22
2.1
23
88
3
71
56
2
0
41
1.11
12614258--12614360
47
2.2
47
79
6
111
56
3
0
38
1.24
12614340--12614384
23
2.0
23
86
8
65
73
0
2
24
0.95
12614355--12614390
9
3.9
9
89
7
54
77
0
2
19
0.88
12614340--12614397
5
11.0
5
77
22
57
74
0
3
22
0.97
12621192--12621216
13
1.9
13
100
0
50
40
24
4
32
1.73
12623944--12624000
29
2.0
29
96
0
105
42
14
19
24
1.88
12632180--12632241
17
3.6
17
91
0
106
9
0
35
54
1.33
12632169--12632241
34
2.1
35
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7
105
10
0
32
56
1.34
12632315--12632361
23
2.0
24
87
4
69
27
2
21
48
1.61
12632230--12632643
160
2.7
151
79
12
479
37
2
18
40
1.65
12632488--12632545
17
3.4
17
85
2
71
15
0
31
53
1.42
12632668--12632995
126
2.6
124
90
4
505
36
16
17
28
1.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
12634746--12634801
25
2.2
25
93
0
94
39
10
33
16
1.83
12637170--12637212
18
2.4
18
88
0
59
44
9
27
18
1.80
12638884--12638929
11
4.4
11
81
8
51
45
0
26
28
1.54
12639544--12639597
19
2.8
20
77
8
67
66
0
3
29
1.09
12639652--12639711
29
2.1
29
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0
111
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16
20
31
1.95
12639907--12640012
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20
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30
2
0
66
1.13
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10
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10
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29
2
1
66
1.15
12639906--12640025
9
12.6
9
71
10
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30
2
1
65
1.15
12639906--12640017
19
5.8
19
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93
29
2
1
66
1.16
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29
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29
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100
31
2
0
64
1.13
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39
3.9
39
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11
123
27
4
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64
1.29
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21
2.0
21
100
0
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28
23
4
42
1.74
12645813--12645872
19
3.0
20
75
17
63
43
0
1
55
1.10
12651223--12651268
22
2.1
22
100
0
92
30
8
21
39
1.84
12658120--12658265
72
2.0
72
97
0
274
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20
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1.94
12659928--12660006
42
1.9
41
82
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97
32
7
7
51
1.58
12669959--12670137
39
4.6
39
87
0
250
12
27
22
36
1.91
12671631--12671696
20
3.3
20
82
0
69
45
16
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33
1.68
12674094--12674144
25
2.0
25
100
0
102
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1.63
12678174--12678241
30
2.3
30
84
5
84
47
5
19
27
1.72
12680371--12680648
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6.0
46
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346
40
13
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21
1.89
12680929--12680961
17
2.0
17
94
5
59
51
0
12
36
1.39
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
12684494--12684521
6
4.7
6
100
0
56
46
0
0
53
1.00
12684844--12684912
34
2.0
34
100
0
138
23
2
34
39
1.70
12686387--12686465
37
2.1
37
97
0
149
46
15
27
10
1.77
12689533--12689586
25
2.1
26
86
10
76
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1
5
31
1.30
12690270--12690303
16
2.2
15
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50
55
2
0
41
1.15
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17
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0
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0
0
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0.95
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140
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2
3
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1.32
12718847--12718882
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2.4
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0
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1.46
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18
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0
61
8
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2
51
1.47
12722250--12722287
21
1.9
21
89
10
62
31
2
2
63
1.22

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378