Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr01 113035596 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  113035596

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  29  of  378  ( 45343 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.81
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.2
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2.1
176
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138
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20
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3.7
54
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1
319
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21
24
19
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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G
T
Entropy
(0-2)
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17
1
33
1.56
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
7211721--7211829
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18
0
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1.56
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0
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1.50
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6
58
1.25
7217031--7217087
28
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28
100
0
114
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3
14
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1.59
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43
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27
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7224674--7224763
46
2.0
46
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8
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50
27
0
3
69
1.03
7228960--7229017
23
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24
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31
0
5
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1.16
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32
1
1
64
1.11
7229389--7229449
14
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0
1
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1.01
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0
1
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7229685--7229724
18
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22
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1.28
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2.0
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100
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19
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3
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43
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43
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27
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1.95
7234143--7234221
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2
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20
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7234633--7234661
13
2.1
14
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6
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55
10
0
34
1.34
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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129
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3
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18
27
1.94
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22
2.5
21
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11
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1
15
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44
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1.96
7242574--7242977
88
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87
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3
506
26
28
15
29
1.96
7242574--7242977
132
3.1
130
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4
508
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28
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1.96
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39
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1.82
7249205--7249323
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2.3
52
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34
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1.82
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228
2.0
228
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7
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13
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18
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28
0
6
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3.2
20
85
8
73
58
29
1
10
1.40
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
7271933--7271970
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0
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0
0
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176
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23
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1.97
7272268--7273123
132
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131
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26
23
18
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1.98
7272251--7273123
308
2.8
308
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0
1568
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3.2
132
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0
739
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8.0
6
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0
87
0
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14
52
1.42

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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