Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr01 113035596 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  113035596

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  338  of  378  ( 45343 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
102528427--102528501
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22
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4
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11
32
1.86
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.4
24
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2.8
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100
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14
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122
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1.95
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1.9
33
100
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128
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1.95
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2.5
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0
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60
5
17
17
1.55
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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14
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2
31
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30
1.14
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2.4
24
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5
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1.43
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7
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1.50
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4.1
16
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3
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0
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42
1.45
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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Entropy
(0-2)
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2.7
26
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0
48
1.17
102644921--102644949
13
2.1
14
93
6
51
20
0
0
79
0.74
102645794--102645929
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5.2
26
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0
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33
5
24
36
1.78
102647367--102647464
26
3.8
26
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4
128
33
22
14
29
1.93
102647378--102647464
25
3.4
26
90
4
133
31
24
16
28
1.96
102647567--102647705
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5.2
27
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4
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17
24
23
34
1.96
102647567--102647705
54
2.6
54
88
3
192
17
24
23
34
1.96
102651609--102651743
26
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26
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0
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1.78
102653357--102653469
27
4.2
27
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3
129
16
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23
36
1.94
102653355--102653469
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54
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23
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102654483--102654645
3
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10
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5
0
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102655015--102655244
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0
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15
17
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1.91
102656395--102656504
26
4.2
26
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2
177
34
4
24
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1.76
102658111--102658223
27
4.2
27
82
3
120
17
23
22
36
1.95
102658109--102658223
54
2.1
54
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3
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17
23
22
36
1.95
102662351--102662405
25
2.3
23
78
12
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43
3
16
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1.65
102662461--102662535
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3.3
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5
29
1.41
102662467--102662673
25
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13
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1.43
102663161--102663229
30
2.3
30
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0
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1.70
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27
6.0
27
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197
35
22
23
17
1.95
102664426--102664587
53
3.0
54
90
3
247
35
22
23
17
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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26
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102667180--102667369
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16
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1.90
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36
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17
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1.93
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14
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17
28
1.94
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670
33
19
15
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1.93
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2.7
216
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15
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1.94
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1.94
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18
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50
0
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0
1.00
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0
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0.98
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0
2
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4.2
30
94
0
207
18
6
50
25
1.70
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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23
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102688357--102688486
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3.2
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23
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21
17
1.93
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3.3
44
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116
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22
1.97
102688555--102688706
44
3.5
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20
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0
0
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2.1
25
100
0
104
40
26
7
25
1.82

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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