Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr01 113035596 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  113035596

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  31  of  378  ( 45343 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.0
420
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1.70
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
A
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G
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Entropy
(0-2)
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52
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20
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29
29
20
20
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6.9
24
70
19
79
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5
31
1.42
7630492--7630609
26
4.5
26
75
9
91
59
5
5
29
1.43
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.8
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2
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1.33
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0
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12
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2.2
24
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6
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2.0
22
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11
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1.97
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2.4
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12
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59
7
6
27
1.49
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
7695660--7695713
27
2.0
27
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3
18
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2
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2
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2
0
48
1.14
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21.7
3
93
0
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3
0
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12
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2
0
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1.9
18
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0
52
40
8
0
51
1.33
7702120--7702175
28
2.0
28
96
0
103
26
10
17
44
1.82
7705481--7705559
39
2.0
39
95
0
140
21
13
21
43
1.87
7708905--7709071
24
7.0
24
97
0
280
29
31
28
11
1.91
7709139--7709252
60
1.9
60
96
0
210
25
30
21
21
1.99
7710299--7710327
6
4.8
6
100
0
58
68
13
17
0
1.20
7717006--7717064
29
2.0
29
93
0
100
40
0
35
23
1.55
7720403--7720469
30
2.2
31
84
7
84
49
19
10
20
1.77
7723638--7723915
139
2.0
139
100
0
556
28
20
17
32
1.96
7724996--7725156
38
4.2
38
91
0
259
20
21
26
31
1.98
7725150--7725277
46
2.9
45
82
7
131
25
21
28
24
1.99
7727511--7727645
54
2.4
54
85
10
166
28
18
22
31
1.97
7728873--7728902
14
2.1
14
100
0
60
23
13
10
53
1.69
7728997--7729041
21
2.2
20
88
4
63
26
28
20
24
1.99
7731546--7732206
159
4.2
159
92
3
1079
21
17
26
33
1.96
7731546--7732206
312
2.1
313
93
2
1112
21
17
26
33
1.96
7731546--7732353
159
5.1
158
87
4
656
22
17
26
33
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
7740845--7740966
61
2.0
61
98
0
235
20
26
13
39
1.90
7741563--7741676
42
2.7
43
81
6
135
28
27
14
30
1.95
7741648--7741767
47
2.6
45
80
6
141
29
25
15
30
1.95
7741796--7742037
31
7.8
31
91
0
376
25
27
19
27
1.99
7742013--7742141
50
2.5
51
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5
190
25
21
16
36
1.94
7745803--7745873
13
5.5
13
77
0
70
38
23
8
29
1.85
7745803--7745873
26
2.7
26
82
0
88
38
23
8
29
1.85
7748387--7748497
47
2.4
47
84
6
154
35
23
16
25
1.95
7755641--7755751
47
2.4
47
84
6
154
35
23
16
25
1.95
7759096--7759166
31
2.3
31
100
0
142
69
2
11
16
1.30
7768512--7768591
24
3.3
24
85
0
115
27
35
17
20
1.95
7775023--7775095
3
24.3
3
91
0
119
31
0
2
65
1.06
7777253--7777277
12
2.1
12
100
0
50
48
0
16
36
1.46
7780151--7780424
46
6.0
46
92
0
406
23
25
14
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1.92
7780322--7780401
25
3.4
24
65
31
64
23
28
15
32
1.95
7782565--7782592
11
2.5
11
100
0
56
71
0
0
28
0.86
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19
3.7
21
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10
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60
6
0
32
1.22
7785038--7785098
15
4.1
14
70
8
50
49
3
1
45
1.28
7790651--7790790
3
47.0
3
82
1
165
63
0
5
30
1.21
7790813--7790859
20
2.3
20
85
0
58
59
2
4
34
1.29
7790651--7790865
18
10.9
20
70
12
97
61
1
6
29
1.31
7790881--7790915
7
4.9
7
89
6
52
82
0
2
14
0.77
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
7790972--7791028
13
4.3
13
77
16
55
66
5
5
22
1.32
7793316--7793367
27
1.9
27
84
7
70
36
0
26
36
1.57
7796689--7796721
16
2.0
17
88
5
50
39
24
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30
1.79
7798904--7798929
2
13.0
2
100
0
52
50
0
0
50
1.00
7798971--7799036
29
2.2
30
83
2
89
51
3
0
45
1.16
7800642--7800679
14
2.7
14
84
12
51
50
7
5
36
1.54
7802239--7802270
15
2.1
16
94
5
57
59
0
9
31
1.29
7805297--7805340
12
3.8
12
78
6
54
25
6
0
68
1.14
7805512--7805563
21
2.5
21
93
0
86
17
17
17
48
1.82
7807701--7807741
22
1.9
22
85
5
57
31
4
4
58
1.40

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
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          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378