Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr01 113035596 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  113035596

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  89  of  378  ( 45343 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
24023986--24024586
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79
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194
29
23
22
24
1.99
24023986--24024586
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3.7
161
84
7
738
29
23
22
23
1.99
24023988--24024586
245
2.4
245
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1
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22
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1.99
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2.2
175
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20
20
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2.0
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0
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1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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18
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27
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18
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73
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0
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2.0
21
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2.3
18
91
4
64
52
10
27
10
1.66
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
24114482--24114657
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28
29
1.98
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1.8
93
95
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310
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20
29
28
1.98
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1.9
37
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43
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1.86
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2.2
23
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2.0
20
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5
23
23
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1.70
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20
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0
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1.98
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14
25
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1.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
24205881--24205930
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10
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1.20
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52
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1
3
23
1.08
24207757--24207821
10
6.8
10
69
20
50
70
1
1
26
1.04
24207773--24207849
35
2.2
35
81
4
93
74
1
3
20
1.06
24213594--24213659
33
2.0
33
100
0
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21
9
9
60
1.54
24221665--24221823
24
6.6
24
97
0
273
36
25
17
20
1.94
24221643--24221823
48
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47
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2
245
35
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24233671--24233781
24
4.6
24
95
0
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24235817--24235890
30
2.5
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2
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32
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34
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34
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1
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2.3
30
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83
0
33
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5
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0
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1.10
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29
3.5
29
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0
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23
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27
1.95
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29
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0
150
23
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15
27
1.95
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33
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0
117
20
15
7
55
1.65
24251842--24251902
30
2.0
30
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1.20
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2.0
95
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0
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1.98
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32
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13
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2
14.0
2
100
0
56
50
0
0
50
1.00
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23
2.7
23
80
7
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50
1
0
48
1.11
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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43
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4
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29
25
20
25
1.99
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86
3.3
85
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344
29
24
19
25
1.99
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26
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0
184
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5
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9
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9
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0
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0
3
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1
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1.12
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25
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22
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0
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0
0
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14.3
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23
1
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10.8
40
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225
28
20
19
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120
1.8
120
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343
29
21
19
29
1.98
24276962--24277119
79
2.0
80
84
1
210
27
21
18
31
1.97
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39
3.7
39
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0
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20
29
22
1.99
24281483--24281665
78
2.3
79
90
1
278
24
22
29
23
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
24283067--24286033
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5.4
554
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2
3976
25
22
10
41
1.85
24286027--24289252
554
5.8
555
86
3
4491
25
21
10
42
1.84
24290724--24290885
43
3.8
43
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32
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1.96
24292847--24292885
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2.3
17
100
0
78
38
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15
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1.92
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553
4.4
551
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3397
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20
10
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1.84
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26
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0
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0
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36
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3.6
10
92
7
56
22
8
0
69
1.15

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378