Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr01 113035596 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  113035596

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  260  of  378  ( 45343 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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142
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23
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Percent
Indels
Score
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10
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0
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28
1.68
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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Entropy
(0-2)
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1.99
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190
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1.99
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30
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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133
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19
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29
1.96
78205229--78206005
311
2.5
308
73
11
765
31
21
18
28
1.97
78209408--78209588
40
4.6
40
86
2
249
25
23
24
25
2.00
78211139--78211181
15
2.9
14
80
10
50
2
4
11
81
0.93
78211148--78211191
21
2.1
21
83
4
54
4
11
11
72
1.25
78216336--78216372
17
2.2
17
90
9
58
70
0
2
27
1.01
78216516--78216670
3
52.0
3
72
14
90
63
3
3
30
1.26
78217042--78217074
17
1.9
17
93
0
57
24
0
45
30
1.53
78217800--78217836
19
1.9
19
88
0
56
35
2
21
40
1.68
78221315--78221482
43
4.0
41
80
7
160
26
21
20
31
1.98
78221589--78221682
47
2.0
47
95
0
170
50
24
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20
1.69
78222291--78222319
13
2.1
14
93
6
51
55
10
0
34
1.34
78227729--78227845
9
13.4
9
73
10
84
33
0
17
48
1.48
78227729--78227909
43
4.0
43
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12
254
34
0
16
48
1.47
78227775--78227909
52
2.8
49
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9
192
34
0
16
48
1.46
78227732--78227909
95
1.9
95
95
0
320
34
0
16
48
1.47
78230877--78231047
39
4.3
40
90
3
224
24
20
29
25
1.99
78237450--78237648
99
2.0
99
93
5
341
37
12
27
22
1.90
78246757--78246925
39
4.3
39
88
5
218
24
20
29
25
1.99
78246757--78246933
77
2.3
78
84
5
198
24
20
29
25
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
78252544--78252576
15
2.2
15
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0
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24
18
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51
1.68
78258050--78258097
16
3.1
15
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17
53
39
22
4
33
1.74
78259513--78259680
35
4.6
35
85
7
185
33
23
10
32
1.89
78259508--78259680
75
2.4
73
83
9
210
33
23
10
32
1.89
78261625--78261662
20
1.9
20
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0
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10
0
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1.32
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0
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0
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0.95
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19
4.6
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1.05
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2.0
57
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0
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1.80
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2.3
33
80
0
78
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22
14
34
1.94
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14
2.3
15
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2
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2
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0
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50
0
50
1.00
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0
11
28
1.31
78286450--78286530
8
9.5
8
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16
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59
0
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37
1.15
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16
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0
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0
0
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0.98
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20
4.5
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1.29
78286523--78286587
10
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10
76
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53
58
3
4
33
1.34
78286535--78286622
42
2.1
42
83
8
108
59
1
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32
1.31
78286450--78286622
16
9.1
19
71
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1
5
35
1.28
78286917--78286974
28
2.0
29
86
3
82
39
1
0
58
1.08
78286960--78287001
22
1.9
22
100
0
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0
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78307167--78307191
8
3.1
8
100
0
50
40
0
36
24
1.55
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
78314460--78314534
29
2.6
29
89
4
107
26
16
32
25
1.96
78316156--78316203
20
2.3
22
79
17
57
29
14
0
56
1.39
78316401--78316450
14
3.5
14
74
15
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50
0
22
28
1.49
78316401--78316456
29
1.9
29
100
0
112
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0
19
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1.49
78321936--78321964
2
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2
100
0
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0
0
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1.00
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0
0
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100
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21
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54
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1
202
28
26
15
29
1.96
78349177--78349256
36
2.2
36
95
2
142
21
40
16
22
1.91

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378