Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr01 113035596 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  113035596

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  294  of  378  ( 45343 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
88861330--88861419
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3.3
28
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88861437--88861634
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2.5
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92
2
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23
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1.81
88861425--88861634
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7.8
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3
255
28
25
7
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1.82
88861593--88861645
27
2.0
27
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0
70
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5
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88861707--88861769
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2.3
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20
20
1.94
88862928--88862974
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2.0
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22
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47
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207
28
22
22
26
1.99
88863127--88863270
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2.0
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3.1
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29
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20
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1.98
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3.0
30
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15
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1.64
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4.5
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20
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28
20
24
1.99
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2.9
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203
26
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2.0
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2.4
16
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51
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7
2
21
1.28
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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0
0
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0
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0
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29
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24
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1.99
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40
5.2
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2
305
25
24
28
21
1.99
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1.95
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41
2.7
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0
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11.7
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12
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2.2
105
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12
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1.47
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2.8
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50
10
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208
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1
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2.2
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4
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2.7
43
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0
207
22
29
20
27
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
88950275--88950325
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1.80
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5.2
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92
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19
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1.81
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2
100
0
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0
0
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1.00
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0
25
1.51
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0
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241
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17
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25
20
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1.97
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1.93
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20
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0.93
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25
1.9
26
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11
68
25
1
3
68
1.17
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
89030796--89031177
124
3.1
126
82
5
445
28
16
16
39
1.90
89030801--89031185
122
3.1
124
79
8
424
29
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15
38
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0
112
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13
0
40
1.44
89032115--89032162
14
3.5
13
75
10
51
58
0
2
39
1.10
89041746--89041915
93
1.8
92
96
1
313
27
30
21
20
1.98
89041738--89041917
45
3.9
46
81
10
233
27
30
21
21
1.98
89044271--89044359
30
3.0
30
80
8
101
57
15
16
10
1.65
89044271--89044350
15
5.4
15
80
7
92
58
13
17
10
1.62
89044282--89044359
15
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15
78
9
79
56
15
16
11
1.67
89044598--89044720
49
2.5
49
95
0
219
29
33
10
26
1.90
89047791--89047889
41
2.4
41
80
11
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24
24
25
26
2.00
89048373--89048680
29
10.7
29
93
2
505
24
33
17
25
1.96
89050693--89050769
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2.1
37
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2
147
20
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19
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1.97
89050872--89050994
49
2.5
49
95
0
219
29
33
10
26
1.90
89058130--89058225
50
1.9
50
97
0
183
42
12
11
33
1.79
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45
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7
181
28
29
21
21
1.99
89063629--89063800
93
1.8
93
91
0
281
27
29
21
21
1.99
89063672--89063815
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29
27
20
22
1.98
89066757--89066941
79
2.3
81
81
7
209
24
27
23
24
2.00
89066757--89066941
40
4.7
40
80
6
189
24
27
23
24
2.00
89068936--89068974
2
19.5
2
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0
78
48
0
0
51
1.00
89071326--89071456
47
2.8
47
82
4
158
32
27
16
22
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
89076068--89076106
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2.2
18
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0
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7
58
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25
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47
4.5
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23
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19
26
1.98
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2.6
30
95
0
140
24
22
18
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1.97
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7
4.4
7
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30
26
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27
22
2.00
89092980--89093109
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26
24
2.00
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1
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1.99
89101016--89101145
40
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23
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2.00
89104017--89104068
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24
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1.46
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2.2
24
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1
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2.0
14
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0
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0
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100
0
0
0
0.00
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2.0
41
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2
151
53
20
2
24
1.58
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6.1
29
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10
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1.9
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1.94
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45
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120
40
14
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13
2.5
13
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0
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21
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0
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18
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2.0
22
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2.0
30
90
0
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0
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85
2.0
85
98
0
331
38
15
21
24
1.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
89140886--89140945
30
2.0
30
100
0
120
36
0
20
43
1.52
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63
2.9
63
86
0
235
27
7
30
35
1.83
89143859--89143902
20
2.1
21
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0
6
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1.11
89143868--89143908
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2.0
20
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57
73
0
9
17
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2.3
21
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0
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39
0
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0
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222
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1.9
19
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36
0
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1.11
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28
2.3
28
81
5
76
43
7
23
25
1.80

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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