Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr01 113035596 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  113035596

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  8  of  378  ( 45343 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
2438375--2438403
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14
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0
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0
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101
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461
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100
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2.1
15
100
0
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12
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24
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1.9
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0
0
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3.7
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0
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52
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0
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2.0
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83
0
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26
0
4
69
1.06
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
2505684--2505744
27
2.3
27
80
8
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54
1
1
42
1.20
2508737--2508784
20
2.4
20
75
6
53
35
0
2
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1.07
2510703--2510763
3
20.0
3
86
9
88
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0
3
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1.10
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22
2.7
23
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17
69
39
1
7
51
1.40
2515577--2515633
10
5.8
10
76
12
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7
8
0
0.79
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72
3.1
71
84
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276
25
19
21
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1.96
2518015--2518049
14
2.5
14
95
0
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17
17
5
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1.55
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231
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18
641
27
18
21
32
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369
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18
20
30
1.96
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2.2
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254
25
17
22
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1.95
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1.9
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1
260
26
15
21
35
1.94
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71
2.0
73
89
2
224
28
15
21
34
1.94
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156
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155
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699
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18
21
34
1.96
2518694--2519194
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5.8
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83
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483
26
18
20
34
1.95
2518694--2519176
170
2.8
170
80
10
493
27
17
20
34
1.95
2522455--2522687
75
3.2
73
84
6
299
25
18
21
34
1.96
2522671--2522705
14
2.5
14
95
0
61
17
17
5
60
1.55
2522686--2522963
75
3.7
75
88
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420
30
17
21
30
1.96
2522455--2523285
241
3.7
234
75
16
674
27
18
21
32
1.96
2523127--2523289
73
2.2
73
88
4
247
26
17
21
34
1.95
2522967--2523619
159
4.0
157
80
9
636
25
17
21
34
1.95
2523286--2523448
73
2.2
74
87
1
229
26
15
20
36
1.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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83
4
550
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17
19
35
1.94
2523371--2523951
179
3.3
176
76
7
568
27
17
19
35
1.94
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3
23.0
3
88
11
106
33
0
1
65
1.02
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22
2.7
23
77
17
69
39
1
7
51
1.40
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5.7
46
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1
422
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14
23
22
1.90
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11
2.7
11
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5
53
90
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3
0
0.55
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27
17
21
34
1.95
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73
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334
26
17
21
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1.95
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14
2.5
14
95
0
61
17
17
5
60
1.55
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77
5.0
87
81
11
384
27
17
19
34
1.95
2536523--2536800
75
3.7
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411
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17
21
30
1.96
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2.2
73
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4
247
26
17
21
34
1.95
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159
5.5
157
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12
642
26
17
20
35
1.95
2537123--2537285
73
2.2
74
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1
229
26
15
20
36
1.93
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4
584
27
17
19
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1.94
2537208--2537788
179
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176
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586
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17
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1.49
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2.0
34
100
0
134
53
5
5
34
1.50
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
2548118--2548189
34
2.2
34
87
7
105
51
6
8
33
1.59
2557782--2557885
53
2.0
52
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1
199
25
30
11
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10
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10
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0
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0
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0
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14
0
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2561792--2561832
5
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10
50
82
14
0
2
0.76
2565843--2566017
87
2.0
87
96
1
323
44
12
10
33
1.75
2566052--2566081
13
2.3
13
94
0
51
23
33
6
36
1.81
2566506--2566539
1
34.0
1
87
0
50
94
2
2
0
0.38
2566535--2566569
15
2.3
15
90
0
52
62
28
0
8
1.24
2567421--2567466
22
2.3
19
85
11
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36
2
2
58
1.22
2569147--2569182
12
3.0
12
95
0
63
27
25
5
41
1.77
2574467--2574727
69
3.7
68
78
11
269
26
14
22
37
1.92
2574300--2574886
260
2.3
253
93
5
989
25
14
22
36
1.93
2574620--2574850
119
1.9
123
87
7
346
25
14
22
37
1.93
2574556--2575056
210
2.5
199
81
10
555
26
15
22
35
1.94
2574749--2574889
72
2.0
69
87
5
203
21
17
23
38
1.93
2574881--2575145
125
2.1
126
93
5
459
26
17
20
36
1.94
2575211--2575245
14
2.5
14
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0
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17
20
5
57
1.60
2575226--2575387
74
2.1
76
86
6
222
29
19
20
30
1.97
2575079--2575721
164
3.9
167
91
3
989
27
18
20
32
1.97
2575079--2575721
331
1.9
328
89
3
1004
27
18
20
32
1.97
2575408--2576081
77
8.5
76
71
17
292
29
17
19
33
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
2575578--2576081
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73
76
13
411
29
17
19
34
1.94
2575556--2576288
87
9.2
75
72
16
411
28
17
18
35
1.94
2575933--2575970
14
2.8
13
88
4
58
28
15
5
50
1.66
2575578--2575954
154
2.5
149
80
8
444
30
17
19
33
1.95
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30
2.1
30
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6
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19
9
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1.83
2575717--2576289
254
2.3
248
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8
717
27
16
19
36
1.93
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6.2
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12
403
24
14
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1.91
2582905--2583151
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2.0
124
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24
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22
39
1.90
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263
2.3
257
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2
1042
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22
36
1.93
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2.3
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244
22
15
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1.89
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124
2.2
126
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5
438
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16
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1.94
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335
1.9
341
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8
844
26
16
21
36
1.94
2583520--2583554
14
2.5
14
90
0
52
17
20
5
57
1.60
2583387--2583958
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74
15
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26
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16
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29
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165
3.4
165
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1
889
27
19
20
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1.97
2583379--2584027
329
1.9
329
87
6
948
27
18
20
32
1.96
2583863--2584390
72
6.7
76
77
11
426
28
17
18
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1.94
2584241--2584276
14
2.7
13
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13
5
50
1.65
2584372--2584433
30
2.1
30
90
6
99
19
9
29
41
1.83
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255
2.3
247
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733
27
16
18
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1.93
2585272--2585308
16
2.3
16
85
0
56
62
29
0
8
1.24
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
2587395--2587457
28
2.2
29
83
8
76
30
0
4
65
1.13
2587385--2587434
18
2.7
19
78
9
59
28
0
4
68
1.08
2587430--2587499
19
3.7
19
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17
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34
1
4
60
1.25
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16
2.5
15
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8
58
31
0
0
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0.90
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2.3
30
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16
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7
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1.52
2595208--2595263
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2.9
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2
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13
2.9
14
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7
55
50
0
0
50
1.00

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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