Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr01 113035596 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  113035596

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  101  of  378  ( 45343 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
27687399--27687440
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0
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2.7
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2.1
31
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14
39
1.91
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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T
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23
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182
33
17
28
21
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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4.7
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19
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22
1.98
27763795--27764059
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5.7
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195
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19
30
22
1.98
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1.8
140
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22
1.98
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21
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1.99
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1.99
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27
21
22
28
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
27775201--27775257
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36
1.90
27775296--27775343
25
1.9
25
91
0
78
25
14
25
35
1.94
27776503--27776558
27
2.1
27
87
9
80
21
25
23
30
1.99
27776625--27776794
27
6.3
27
73
13
107
31
8
20
40
1.81
27776773--27777245
27
17.6
27
85
0
525
41
8
22
27
1.82
27777249--27777347
27
3.7
27
79
5
103
31
10
18
40
1.83
27777241--27777345
54
2.0
53
81
9
124
31
10
20
38
1.86
27776774--27777252
81
5.9
81
90
2
705
41
7
23
27
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27777257--27777362
27
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16
38
1.82
27780049--27780139
42
2.2
42
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4
121
41
20
9
27
1.84
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23
7.0
23
90
2
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28
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23
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1.99
27780278--27780441
47
3.5
47
94
0
276
28
21
23
26
1.99
27780280--27780441
70
2.3
70
92
2
263
28
21
23
26
1.99
27788534--27788578
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2.2
20
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0
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2
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1.54
27789120--27789275
57
2.7
58
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28
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1.96
27794911--27794939
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15
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51
20
0
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1.47
27795484--27795650
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43
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32
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14
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1.95
27799931--27799962
13
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2.0
52
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0
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22
28
25
1.99
27834152--27834197
20
2.3
20
96
0
83
43
2
50
4
1.34
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
27844525--27844569
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2.2
20
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0
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48
2
13
35
1.54
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57
2.7
58
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1.96
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14
2.0
15
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51
20
0
27
1.47
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43
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43
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1.98
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0
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1.97
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1.95
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28
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14
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1.95
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2.4
43
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1.92
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2.3
19
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28
22
1.99
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13
211
27
20
28
22
1.99
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2.3
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4.2
40
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5
207
26
28
22
23
1.99
27890148--27890315
80
2.1
80
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26
28
22
23
1.99
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48
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9
174
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24
16
29
1.96
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2.6
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10
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27
1.9
27
88
0
77
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1.90
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27
2.0
27
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20
22
22
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1.97
27920816--27920988
46
3.7
46
75
14
176
23
18
27
31
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
27920813--27920983
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1.8
93
93
2
299
22
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28
30
1.98
27923851--27924023
46
3.8
45
80
10
215
21
21
27
28
1.99
27923848--27924018
93
1.8
93
96
0
315
21
22
28
28
1.99
27927492--27927597
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1.9
55
82
0
131
20
25
26
27
1.99
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2.1
55
80
0
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26
27
1.99
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2.7
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29
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0
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1.98
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205
29
28
19
21
1.98
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15
4.4
15
84
11
89
60
12
15
10
1.58

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378