Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr01 113035596 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  113035596

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  248  of  378  ( 45343 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
73957872--73957947
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2.1
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100
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20
20
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281
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1.95
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71
2.3
71
100
0
328
18
28
17
35
1.94
74046353--74046550
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2.8
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3.6
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32
1.85
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
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122
30
27
14
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1.95
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22
29
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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2.0
20
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25
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Indices
Period
Size
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Consensus
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Score
A
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Entropy
(0-2)
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31
1.97
74214583--74214617
13
2.7
13
95
0
61
31
0
5
62
1.18
74215514--74215577
14
4.6
14
82
7
76
25
31
3
40
1.71
74215514--74215577
28
2.3
28
89
5
94
25
31
3
40
1.71
74215533--74215578
14
3.3
14
93
0
83
21
28
6
43
1.77
74216767--74216836
6
11.2
6
73
8
50
70
1
21
7
1.20
74216778--74216836
18
3.2
18
80
7
66
69
0
22
8
1.15
74220039--74220210
93
1.8
93
92
2
292
29
28
20
22
1.98
74220032--74220207
46
3.8
46
79
14
200
30
28
19
21
1.98
74221636--74221682
20
2.3
21
85
3
69
21
27
19
31
1.97
74221895--74221929
13
2.7
13
95
0
61
31
0
5
62
1.18
74224061--74224213
58
2.6
58
83
7
184
35
13
16
33
1.89
74224512--74225030
213
2.4
213
79
5
528
24
18
22
35
1.96
74224512--74225067
71
7.8
71
72
4
341
24
17
22
35
1.96
74224693--74225037
143
2.4
142
79
5
322
24
18
22
33
1.96
74228916--74229013
48
2.0
48
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0
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29
23
18
28
1.98
74229354--74229412
30
2.0
30
82
0
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37
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35
1.76
74254788--74254963
50
3.5
49
80
7
176
28
27
17
26
1.98
74254831--74254911
26
3.2
26
66
25
73
30
28
13
27
1.94
74254788--74254974
101
1.9
99
84
4
250
28
28
17
25
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
74258780--74258952
38
4.5
37
79
5
159
21
23
24
30
1.99
74263982--74264020
18
2.2
18
85
0
51
51
0
38
10
1.36
74266832--74266873
21
2.0
21
86
4
59
26
2
2
69
1.13
74273625--74273844
46
4.7
46
75
9
198
29
20
28
21
1.98
74280644--74281092
47
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47
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0
700
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25
1.92
74280684--74280758
24
3.2
24
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24
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28
13
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26
1.94
74280873--74280948
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3.3
22
66
16
64
32
11
28
26
1.92
74289269--74289308
21
2.0
21
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5
55
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22
1.90
74291716--74291824
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110
30
16
22
31
1.96
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40
4.7
40
88
5
227
27
21
26
24
1.99
74293810--74293921
40
2.8
40
83
5
102
26
21
27
24
1.99
74300553--74300674
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2.9
42
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2
154
28
15
27
27
1.96
74304785--74304907
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2.9
43
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4
214
13
25
33
28
1.93
74305249--74305349
42
2.3
44
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13
129
23
24
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22
1.99
74311689--74311798
42
2.6
42
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7
125
24
20
25
30
1.99
74320966--74321220
38
6.7
38
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0
411
21
23
24
30
1.99
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45
3.0
44
82
8
153
25
22
28
23
2.00
74322524--74322563
18
2.3
17
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16
55
52
0
22
25
1.47
74328552--74328608
20
2.9
19
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5
69
21
14
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43
1.87
74331301--74331392
48
1.9
48
88
4
141
25
16
28
30
1.96
74333281--74333323
22
2.0
22
81
9
52
13
27
34
23
1.93
74335157--74335352
50
3.9
50
80
3
198
28
26
19
26
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
74335170--74335356
101
1.9
99
85
2
257
28
27
18
25
1.98
74340613--74340750
49
2.8
50
85
4
190
30
28
15
25
1.96
74340613--74340811
99
2.0
99
81
3
229
29
28
16
25
1.97
74347558--74347619
30
2.1
30
96
0
115
25
29
4
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1.76
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3.0
12
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0
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0
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8
0.90
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2.2
13
100
0
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55
13
0
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1.94
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1.89
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14
87
0
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1.51
74369864--74369904
18
2.3
18
95
0
73
24
29
31
14
1.95

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378