Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr13 124041150 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  124041150

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  1  of  410  ( 49152 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
1--3324
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24
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26
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2.3
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2
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1.13
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
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2
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20
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2
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1.23
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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Entropy
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1.31
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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Entropy
(0-2)
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11
1798
23
30
5
40
1.78
254589--254781
90
2.1
90
96
0
350
24
30
5
39
1.79
254271--255868
396
3.9
402
88
7
2167
23
30
5
39
1.78
255272--255303
3
10.7
3
93
0
55
0
28
0
71
0.86
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6
5.5
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0
57
0
21
0
78
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235
2.4
238
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4
760
41
20
7
30
1.80
260467--260500
13
2.6
13
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0
59
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0
8
0
0.43
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6
4.9
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88
11
50
90
0
9
0
0.45
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3
9.0
3
100
0
54
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0
0
33
0.92
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63
2.0
62
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4
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25
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25
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0
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0
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18
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0
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0
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2
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0
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0
0
50
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22
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8
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27
13
11
47
1.77
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9
10.8
9
75
16
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69
0
1
29
0.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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22
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0
0
29
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1
0
30
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11
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0
2
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17
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0
0
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1
0
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19
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20
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0
0
30
1.01
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1
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130
2.0
130
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0
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5
0
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330477--330515
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2.3
17
100
0
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5
0
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4
31
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1.9
22
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4
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331069--331137
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11
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12
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2
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22
3.1
20
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10
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4
2
38
1.36
331124--331162
18
2.0
20
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2
2
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15
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0
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0
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1.25
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17
1.9
17
93
0
57
15
12
57
15
1.65
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
349759--349869
47
2.4
47
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6
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22
14
26
1.92
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40
3.0
40
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0
204
28
24
2
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1.66
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25
2.5
26
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10
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2.0
25
100
0
100
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0
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0
0
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6
100
0
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32
0
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28
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1
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0
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0
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44
2.8
45
82
4
152
34
13
24
27
1.93

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410