Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr13 124041150 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  124041150

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  52  of  410  ( 49152 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.85
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5.7
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180
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30
18
27
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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42
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100
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29
1.98
13691173--13691342
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1.8
94
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254
24
28
17
28
1.97
13691678--13691759
30
2.7
30
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31
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2.3
26
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20
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247
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23
22
1.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.94
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2.0
122
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1.93
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34
55
1.32
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
13726943--13727012
21
3.3
21
97
0
131
8
32
1
57
1.38
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47
4.7
48
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9
170
24
27
19
28
1.98
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47
2.6
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14
133
27
27
17
27
1.97
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20
2.7
20
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37
0
5
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0
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14
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22
1.90
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0
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36
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13745908--13746195
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2.0
144
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486
30
27
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1.83
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2.1
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1.99
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23
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28
1.99
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1.98
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48
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459
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27
7
33
1.84
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
13755297--13755583
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31
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33
1.84
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28
1.98
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1.9
140
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0
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2.6
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225
36
9
20
33
1.85
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
13843783--13843827
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11
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16
1.44

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410