Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr13 124041150 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  124041150

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  357  of  410  ( 49152 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
110169347--110169376
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3.3
9
90
0
51
46
3
10
40
1.54
110181711--110181837
20
6.1
20
70
16
80
43
16
26
13
1.85
110181758--110181807
26
1.9
26
87
0
73
46
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30
10
1.77
110184445--110184505
31
2.0
31
96
0
113
26
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1.55
110184542--110184614
13
5.5
13
69
9
58
42
15
1
41
1.55
110184542--110184623
13
6.2
13
72
13
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40
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1
41
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110184693--110184752
25
2.4
25
80
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68
33
20
21
25
1.97
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19
2.4
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2.0
27
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0
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5.3
23
75
12
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22
25
1.97
110196319--110196454
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2.9
46
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120
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19
22
25
1.97
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80
0
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6
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1.9
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50
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23
2
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0.80
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85
2.0
85
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0
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2
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1.54
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2.3
25
80
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52
0
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1.32
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44.0
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72
3
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58
3
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30
1.43
110217203--110217345
44
3.3
44
69
11
141
17
23
23
36
1.95
110217108--110217390
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3.3
86
87
3
338
18
22
21
36
1.95
110217403--110217615
87
2.5
86
88
2
309
21
20
21
37
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
110217403--110217603
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4.6
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20
20
21
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110229828--110230003
87
2.0
87
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0
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50
3
12
33
1.57
110229998--110230156
3
53.3
3
70
5
90
57
2
8
30
1.42
110233897--110233935
19
2.1
19
86
13
55
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2
0
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19
2.3
19
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52
16
0
27
55
1.41
110235024--110235067
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2
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0
0
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18
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20
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1.85
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1.9
300
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30
1.94
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2.3
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20
29
1.99
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48
2.5
48
83
0
154
22
29
18
29
1.97
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16
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50
0
0
49
1.00
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2.0
46
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141
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6
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16
4.4
16
92
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113
28
28
5
37
1.80
110287872--110287909
20
1.9
20
84
10
51
23
23
26
26
2.00
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20
1.9
21
89
5
62
0
43
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53
1.14
110292402--110292451
24
2.1
24
96
0
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30
10
36
24
1.88
110297345--110297387
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19
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72
0
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20
1.08
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17
100
0
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22
25
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1.74
110308910--110308950
21
1.9
22
85
5
57
43
0
21
34
1.53
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
110315082--110315132
15
3.3
15
73
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50
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1
1
33
1.17
110315136--110315174
18
2.2
17
86
4
51
66
2
2
28
1.18
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24
1.9
24
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65
4
0
29
1.11
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15.0
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100
0
90
33
0
0
66
0.92
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6.5
6
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55
78
4
0
17
0.93
110317192--110317231
20
2.0
20
90
0
62
75
7
0
17
1.03
110317258--110317298
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87
0
55
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18
40
1.84
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1.9
14
100
0
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14
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1.68
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2.2
23
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21
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5
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38
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0
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60
47
0
2
50
1.13
110332542--110332608
27
2.5
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82
49
0
2
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1.16
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2.2
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58
47
6
2
43
1.41
110335303--110335348
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6.1
8
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52
2
0
45
1.13
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2.1
21
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2
0
46
1.13
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12
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2.1
31
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0
110
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9
40
1.83
Indices
Period
Size
Copy
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Percent
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Percent
Indels
Score
A
C
G
T
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(0-2)
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0
20
40
1.52
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Percent
Indels
Score
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25
18
25
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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12
15
14
1.65

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
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          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410