Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr13 124041150 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  124041150

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  19  of  410  ( 49152 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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3.2
108
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326
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19
11
38
1.88
4926173--4926537
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6.7
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182
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25
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17
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0
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0.91
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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25
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1
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25
2.0
25
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4992826--4993091
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38
2.0
38
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25
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0
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100
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2.7
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3
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104
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5.1
10
83
2
59
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5
1
69
1.20
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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13
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2.00
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22
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28
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26
18
34
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
5090017--5090068
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11
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0
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100
0
52
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26
0
0
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11
2.9
13
80
19
51
78
0
18
2
0.87
5095917--5095966
26
2.0
24
88
7
73
64
6
0
30
1.18
5101929--5101976
17
3.1
16
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8
55
54
2
0
43
1.12
5102045--5102118
37
2.0
38
97
2
141
29
9
10
50
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5112514--5112667
66
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66
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2
202
31
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5
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19
0
40
1.51
5127299--5127424
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18
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4
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10
34
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5127313--5127418
36
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36
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5127542--5127628
21
4.0
23
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10
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37
25
21
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5127981--5128021
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15
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12
0
34
1.38
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5
9.0
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5
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59
0
0
40
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30
2.3
30
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48
4
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29
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1.89
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1.82
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23
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74
2.0
74
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0
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24
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1.85
5155389--5155503
35
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35
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23
36
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30
1.87
5156050--5156094
19
2.3
19
92
3
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28
17
13
40
1.88
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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19
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0
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15
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15
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0
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17
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1.63
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30
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0
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10
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60
1.9
60
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0
140
17
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1.60
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3.3
30
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15
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0
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0
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1.76
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1.75
5172252--5172385
26
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26
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220
37
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4
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1.75
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20
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0
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2.0
19
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0
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0
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0
5
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19
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19
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36
0
7
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21
2.0
21
100
0
86
60
4
4
30
1.37
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
5181488--5181526
19
2.0
20
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5
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5
5
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1.45
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0
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0
0
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7
100
0
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15
0
42
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2
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2
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0
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3
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0
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0
0
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111
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2
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13.2
9
72
17
85
28
4
1
66
1.19

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410