Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr13 124041150 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  124041150

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  21  of  410  ( 49152 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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26
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0
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1.38
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
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48
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92
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2.5
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2.2
123
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45
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24
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18
1.95
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44
3.6
44
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11
119
36
24
22
16
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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22
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0
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1.94
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131
34
21
16
27
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
5669197--5669421
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31
1.94
5669487--5669645
71
2.2
72
89
5
243
40
22
15
22
1.90
5669521--5669767
123
2.0
123
89
3
381
39
21
13
24
1.90
5669645--5669820
71
2.5
71
86
2
230
35
22
14
28
1.93
5679352--5679423
24
2.9
25
84
8
103
4
2
20
72
1.15
5679352--5679424
26
3.0
25
86
7
105
4
2
20
72
1.14
5680063--5680142
17
4.6
17
70
13
56
55
6
1
37
1.33
5680047--5680115
30
2.4
28
78
4
84
57
4
0
37
1.18
5684740--5684809
3
23.7
3
91
2
115
62
0
2
34
1.10
5688906--5689126
3
73.3
3
77
7
207
30
6
1
61
1.29
5694992--5695155
88
1.9
89
86
1
240
31
19
23
25
1.98
5695019--5695241
44
5.1
44
78
2
216
30
19
23
26
1.98
5695085--5695287
86
2.4
86
82
1
237
29
19
21
29
1.98
5695280--5695449
44
3.9
44
69
7
130
29
22
20
27
1.98
5695019--5695310
130
2.2
130
80
3
309
30
20
21
27
1.98
5695291--5695882
88
6.7
88
87
0
815
28
22
19
29
1.98
5695324--5695547
44
5.1
44
69
12
172
28
21
21
28
1.99
5695833--5695939
53
2.0
53
94
0
187
27
23
16
32
1.96
5695931--5696069
44
3.2
44
65
11
113
25
23
22
28
1.99
5695745--5696023
141
2.0
141
92
0
468
27
22
19
30
1.98
5695689--5696111
229
1.8
229
89
1
659
27
23
19
29
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
5695589--5696203
317
1.9
317
88
0
926
27
22
20
29
1.98
5695481--5696287
405
2.0
405
88
1
1197
28
22
19
30
1.98
5695393--5696374
493
2.0
493
87
0
1437
28
22
20
29
1.98
5695886--5696397
88
5.8
88
87
0
736
28
21
20
29
1.98
5696455--5697392
45
21.0
44
70
13
355
32
16
21
29
1.95
5696412--5697392
180
5.5
181
82
6
1169
32
16
21
29
1.95
5696970--5697228
87
3.0
87
91
1
403
28
13
26
30
1.94
5696412--5697385
353
2.7
355
84
6
1211
32
16
21
29
1.95
5696999--5697257
87
3.0
87
89
3
371
29
14
25
30
1.95
5699022--5699054
13
2.6
13
90
4
50
39
0
12
48
1.40
5700215--5700350
68
2.0
68
98
0
263
36
25
16
22
1.95
5708610--5708930
3
107.3
3
77
6
294
30
6
1
61
1.30
5708584--5708657
33
2.3
33
79
6
80
32
5
1
60
1.27
5712014--5712185
93
1.8
93
94
0
308
27
28
21
22
1.99
5712009--5712181
46
3.7
46
77
13
201
28
27
21
22
1.99
5713527--5713560
17
2.0
17
94
0
59
41
0
26
32
1.56
5714423--5714484
32
1.9
33
81
15
76
19
14
3
62
1.44
5717308--5717367
30
2.0
30
87
6
86
28
25
6
40
1.80
5723539--5723594
26
2.2
26
93
0
94
32
5
25
37
1.78
5725132--5725174
21
2.1
20
87
12
61
18
11
20
48
1.79
5729270--5729377
26
4.2
26
96
0
189
31
5
25
37
1.79
5730859--5730911
26
2.0
25
82
13
63
35
22
15
26
1.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
5733877--5733951
25
3.0
26
80
13
93
18
25
18
37
1.94
5733938--5734000
25
2.5
25
84
0
81
23
25
23
26
2.00
5735750--5735787
19
2.0
18
90
10
58
68
0
31
0
0.90
5741631--5741682
15
3.3
16
81
10
54
71
1
23
3
1.13
5743772--5743813
16
2.6
16
96
0
75
71
0
26
2
0.98
5744522--5744568
18
2.6
18
80
12
69
34
8
19
38
1.82
5744785--5744856
35
2.1
35
94
0
126
27
5
20
45
1.73
5746326--5746362
13
2.9
13
88
11
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24
0
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13
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9
25
34
1.87
5753152--5753389
72
3.3
72
88
3
349
55
15
5
23
1.63

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
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          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410