Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr13 124041150 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  124041150

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
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This is table  322  of  410  ( 49152 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
100135415--100135442
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2
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0
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3.4
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9
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19
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19
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2.0
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24
15
22
37
1.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.0
26
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25
13
23
38
1.91
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26
5.2
26
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0
227
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5
34
1.78
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26
2.0
26
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2.0
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20
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2.0
72
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6.0
47
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3.3
98
98
0
615
27
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1.92
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48
74
5
128
37
47
0
15
1.46
100218557--100218691
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3.9
35
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145
37
47
0
15
1.46
100219084--100219239
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75
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4
3
62
1.30
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12
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50
34
0
10
56
1.33
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2.5
19
89
6
69
27
21
8
42
1.81
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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44
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24
26
1.97
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132
5.2
132
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1136
30
17
24
26
1.97
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13
8.8
13
81
9
133
40
43
0
16
1.48
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1.9
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0
134
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10
1.37
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73
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1
64
1.20
100228465--100228531
18
3.6
18
78
13
64
29
4
1
64
1.22
100228479--100228535
18
3.0
19
80
14
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33
3
1
61
1.23
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1.9
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100
0
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16
1.90
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1.97
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75
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0
282
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25
1.98
Indices
Period
Size
Copy
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Percent
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Percent
Indels
Score
A
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G
T
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(0-2)
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28
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Matches
Percent
Indels
Score
A
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Entropy
(0-2)
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25
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23
15
28
32
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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9
132
34
27
13
23
1.93

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410