Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr13 124041150 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  124041150

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
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This is table  335  of  410  ( 49152 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
103856808--103856840
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0
0
69
0.88
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16
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0
5
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1.13
103856901--103856971
20
3.3
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0
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28
28
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1.8
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93
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22
21
28
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21
1.97
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10.6
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0
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1.9
18
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0
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137
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9
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1.53
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2.9
16
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65
51
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1.75
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4.0
28
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138
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28
1.95
103921683--103921791
56
1.9
57
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27
14
30
27
1.95
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1.9
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5
166
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5
5
41
1.47
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15
1.9
16
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6
53
70
6
10
13
1.34
103935132--103935331
27
7.4
27
86
2
222
29
23
7
40
1.80
103935132--103935331
54
3.7
54
86
0
256
29
23
7
40
1.80
103935132--103935331
81
2.5
81
87
1
267
29
23
7
40
1.80
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
103935363--103935485
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4.6
27
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6
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39
18
9
31
1.83
103935592--103935693
27
3.8
27
70
10
73
38
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19
22
1.94
103936459--103936528
25
2.8
25
86
0
95
28
24
21
25
1.99
103936748--103936830
31
2.7
30
87
3
114
30
15
26
27
1.96
103938539--103938603
27
2.4
27
84
0
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16
30
7
44
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103938539--103938625
18
4.8
18
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5
77
14
31
10
43
1.79
103938581--103938632
18
2.9
17
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50
13
36
11
38
1.81
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2.1
21
100
0
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13
20
1.64
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14
1.89
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6.2
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1
306
39
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29
14
1.88
103944511--103944550
21
1.9
21
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10
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5
40
1.54
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2.0
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22
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1.51
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1.9
18
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0
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2.0
147
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0
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23
35
1.91
103950123--103950171
22
2.3
21
82
10
64
16
10
2
71
1.22
103950189--103950218
14
2.1
14
93
0
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13
3
16
66
1.37
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53
2.8
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83
6
201
32
20
14
31
1.93
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38
2.0
38
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138
41
7
29
20
1.81
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2
100
0
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48
0
0
51
1.00
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2.3
21
92
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10
40
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1.9
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19
17
29
33
1.95
103968919--103968985
32
2.1
32
83
13
84
13
8
5
71
1.29
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.2
25
90
0
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21
23
36
18
1.95
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25
2.3
23
78
12
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43
3
16
36
1.65
103975083--103975157
22
3.3
22
75
10
69
60
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5
29
1.41
103975089--103975298
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8.4
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6
32
1.43
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2.6
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1.41
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0
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18
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1.72
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1.94
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0
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19
1.94
104004571--104005013
126
3.5
126
87
1
638
37
17
17
27
1.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.5
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0
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7
3.6
7
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0
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60
12
0
28
1.32
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16
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13
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1
3
46
1.30
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2.2
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3
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1.36
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12
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12
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18
53
53
2
2
40
1.29
104011334--104011443
19
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2
2
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1.29
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2.0
26
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0
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11
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2.0
15
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2.0
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0
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0
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1.96
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22
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6
2
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1.32
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1
1
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0
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19
2.1
19
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0
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5
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2
28
1.21
104048622--104048718
3
30.7
3
70
15
54
60
3
4
31
1.31
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
104050253--104050341
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2.0
45
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25
1.98
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3.0
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19
16
25
1.93
104050374--104050689
88
3.6
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327
37
20
15
26
1.93
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5.2
75
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17
28
1.96
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2.6
152
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5
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32
20
17
28
1.96
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5.0
76
79
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18
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1.97
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2.0
89
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0
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0
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12
71
14
53
53
1
6
39
1.36
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
104078734--104078758
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0
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0
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0
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0
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0
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1.9
22
82
17
54
38
2
2
56
1.24

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
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          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410