Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr13 124041150 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  124041150

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  309  of  410  ( 49152 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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28
1.51
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
A
C
G
T
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0
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46
1.71
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Percent
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Percent
Indels
Score
A
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Indices
Period
Size
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Size
Percent
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Percent
Indels
Score
A
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Entropy
(0-2)
96007366--96007614
54
4.6
54
90
0
390
28
22
8
40
1.84
96007366--96007614
81
3.1
80
85
6
349
28
22
8
40
1.84
96007609--96007759
27
5.6
27
86
0
212
40
20
7
31
1.80
96007366--96007643
81
3.4
81
82
2
333
29
22
8
39
1.84
96007609--96007762
54
2.9
54
94
0
263
39
20
7
31
1.81
96013645--96013669
5
5.0
5
100
0
50
60
0
0
40
0.97
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34
3.8
34
76
0
141
27
24
20
27
1.99
96019385--96019594
40
5.2
40
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2
305
21
28
24
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1.99
96027519--96027728
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40
88
2
305
21
28
24
25
1.99
96036029--96036084
19
3.2
19
68
31
61
32
16
23
28
1.96
96035951--96036338
33
11.8
33
86
0
524
28
19
21
30
1.98
96039566--96039590
13
1.9
13
100
0
50
40
0
16
44
1.47
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21
2.0
21
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20
25
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1.90
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47
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48
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8
163
24
29
19
26
1.99
96045364--96045534
46
3.7
47
76
7
163
21
28
19
29
1.98
96062862--96062901
17
2.4
17
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0
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52
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20
1.74
96075388--96075508
43
2.8
42
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5
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27
17
25
29
1.97
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2.2
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29
20
24
25
1.99
96082110--96082181
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2.2
33
97
0
135
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29
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1.95
96087953--96088000
24
2.0
24
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0
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43
16
25
14
1.86
96090136--96090307
93
1.8
93
96
0
317
27
29
21
20
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
96090129--96090304
46
3.8
46
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12
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28
29
21
20
1.98
96097713--96097884
93
1.8
93
96
0
317
27
29
21
20
1.98
96097706--96097881
46
3.8
46
79
12
216
28
29
21
20
1.98
96107210--96107313
52
2.0
52
86
3
147
31
23
16
28
1.96
96109352--96109445
29
3.2
29
96
0
170
26
28
15
28
1.96
96109314--96109445
58
2.3
58
84
2
167
25
33
15
25
1.95
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2
15.5
2
100
0
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0
0
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1.00
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21
2.3
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0
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1.70
96115061--96115164
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25
28
16
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1.97
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100
0
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0
0
50
1.00
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29
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28
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1.97
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14
2.5
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16
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29
13
0
56
1.37
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2
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2
100
0
50
52
0
0
48
1.00
96125773--96125876
29
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5
109
26
28
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1.97
96127172--96127208
14
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16
53
29
13
0
56
1.37
96132274--96132433
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4.5
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1
189
30
8
20
40
1.83
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7.3
6
85
9
65
15
0
0
84
0.62
96162818--96162999
78
2.3
81
83
6
239
25
28
21
24
1.99
96162816--96162999
40
4.7
40
83
8
234
25
28
21
24
1.99
96170939--96171115
40
4.6
39
82
11
215
24
28
22
24
1.99
96179426--96179605
76
2.3
81
83
9
239
25
27
22
25
2.00
96179424--96179605
40
4.7
40
83
10
234
25
28
21
24
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
96184999--96185125
27
4.7
27
73
14
102
44
18
7
29
1.78
96185113--96185227
27
4.3
27
86
0
158
34
18
20
26
1.96
96185667--96185733
27
2.5
27
95
0
116
23
20
25
29
1.99
96185866--96185973
27
4.0
26
75
12
76
20
22
21
36
1.96
96186094--96186180
25
3.5
25
85
0
102
21
20
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1.82
96186141--96186203
12
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12
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20
11
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1.80
96188180--96188302
27
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108
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10
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152
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14
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1.95
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22
3.5
22
87
7
100
19
22
23
34
1.97
96189023--96189131
27
4.1
26
77
12
87
20
22
21
35
1.96

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410