Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr13 124041150 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  124041150

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   

This is table  209  of  410  ( 49152 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
63847757--63847964
40
5.2
40
84
0
218
25
22
25
25
2.00
63847758--63847964
80
2.6
80
83
4
247
25
22
26
25
2.00
63852581--63852729
80
1.9
80
81
2
183
22
30
24
22
1.99
63852622--63852771
40
3.8
40
87
7
189
20
29
24
25
1.99
63852622--63852809
40
4.7
40
84
3
155
20
28
24
26
1.99
63857928--63858102
46
3.8
46
80
15
207
28
29
20
21
1.98
63857936--63858106
93
1.8
93
93
0
297
28
29
21
21
1.98
63857933--63858122
46
4.1
45
74
16
165
28
29
20
21
1.98
63866329--63866549
38
5.7
40
87
7
287
24
20
27
27
1.99
63866329--63866549
78
2.8
79
84
10
301
24
20
27
27
1.99
63866336--63866582
78
3.2
75
82
11
275
26
19
26
26
1.99
63874493--63874719
40
5.7
40
88
4
307
25
21
26
26
1.99
63877880--63877953
29
2.5
30
80
10
89
44
13
13
28
1.82
63878728--63878752
8
3.1
8
100
0
50
84
0
0
16
0.63
63881667--63881695
3
9.7
3
100
0
58
68
0
0
31
0.89
63885125--63885230
53
2.0
53
100
0
212
15
16
11
56
1.67
63888584--63888625
22
2.0
21
81
13
50
11
9
7
71
1.31
63888773--63888825
20
2.6
20
85
8
63
30
0
1
67
1.01
63892993--63893070
42
1.9
42
81
5
97
29
17
23
29
1.97
63895339--63895495
68
2.3
68
85
4
219
35
21
24
19
1.96
63898720--63898771
23
2.3
23
86
3
70
65
3
5
25
1.32
63901449--63901481
17
1.9
17
93
0
57
33
12
30
24
1.91
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
63904813--63904837
13
1.9
13
100
0
50
16
40
24
20
1.91
63908911--63908978
22
3.0
22
70
14
57
38
19
16
26
1.92
63928106--63928154
19
2.5
19
80
6
55
55
2
4
38
1.31
63932602--63932728
23
5.5
22
75
10
103
32
18
21
28
1.96
63932664--63932736
23
3.2
23
70
16
62
34
19
20
26
1.96
63940500--63940628
46
2.8
46
95
0
222
19
21
29
29
1.98
63948030--63948158
46
2.8
46
95
0
222
19
21
29
29
1.98
63949896--63950004
37
2.9
37
94
0
182
27
31
18
22
1.97
63950155--63950251
50
1.9
50
89
4
151
28
25
8
37
1.85
63950209--63950401
47
4.1
47
90
2
246
25
29
10
34
1.90
63950254--63950372
23
5.1
22
62
28
59
24
30
13
31
1.93
63953232--63953570
96
3.5
96
82
4
403
26
19
27
26
1.99
63953232--63953567
48
7.0
48
74
8
279
27
19
27
25
1.99
63961621--63961732
40
2.8
39
89
5
161
27
21
27
23
1.99
63961577--63961762
40
4.7
39
78
7
160
27
20
26
24
1.99
63961621--63961807
80
2.3
80
80
1
187
23
22
29
24
1.99
63963759--63963815
27
2.1
27
100
0
114
49
17
3
29
1.63
63970353--63970473
43
2.9
42
77
2
125
34
24
10
29
1.89
63970353--63970505
42
3.6
42
76
3
119
33
23
11
31
1.90
63970685--63970727
19
2.3
19
87
0
59
30
11
6
51
1.65
63975194--63975235
13
3.2
13
82
0
57
42
16
0
40
1.48
63977053--63977133
40
2.0
40
97
0
153
33
4
25
35
1.78
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
63977959--63977997
19
2.1
19
95
0
69
20
15
15
48
1.81
63985284--63985346
12
5.4
12
71
22
55
47
0
3
49
1.17
63985284--63985346
22
2.7
23
77
20
69
47
0
3
49
1.17
63985307--63985396
30
3.1
27
71
21
67
47
0
4
47
1.22
63985276--63985353
34
2.3
33
79
14
88
44
0
2
52
1.14
63985309--63985442
61
2.3
58
81
11
148
44
1
2
50
1.26
63985410--63985460
26
2.0
26
88
3
77
50
7
0
41
1.31
63985607--63985677
16
4.4
16
85
0
88
30
26
4
38
1.76
63985607--63985677
32
2.2
32
84
0
97
30
26
4
38
1.76
63985707--63985774
21
3.3
21
72
12
77
42
5
1
50
1.35
63985705--63985790
41
2.1
41
95
0
154
44
5
1
48
1.34
63985716--63985801
41
2.2
40
85
4
111
48
5
3
41
1.44
63985851--63985958
52
2.1
52
96
0
198
51
8
13
25
1.69
63986773--63986821
22
2.2
22
81
0
62
61
10
10
18
1.55
63986781--63986820
11
3.6
11
79
0
53
57
10
12
20
1.63
63986782--63986831
22
2.3
22
86
6
66
60
6
16
18
1.55
63987816--63987853
11
3.3
12
85
10
53
63
0
0
36
0.95
63989527--63989563
19
1.9
19
89
10
58
40
0
8
51
1.32
63990125--63990160
19
1.9
18
88
5
54
16
8
25
50
1.73
63993082--63993239
68
2.3
68
83
4
194
37
18
18
24
1.94
63999507--63999734
46
5.0
46
92
1
359
39
14
23
22
1.91
64004149--64004376
67
3.4
67
79
4
237
35
15
24
25
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
64006264--64006438
46
3.8
46
78
11
205
21
20
28
30
1.98
64006260--64006431
92
1.9
93
93
1
301
21
20
29
29
1.98
64006532--64006790
138
1.9
138
95
0
473
38
12
19
28
1.89
64009738--64009818
41
2.0
41
97
0
153
24
7
17
50
1.71
64009905--64009969
21
3.3
21
68
24
68
18
16
16
47
1.83
64009903--64009979
38
2.0
38
100
0
154
19
15
18
46
1.84
64011841--64011888
20
2.4
19
83
10
60
31
6
0
62
1.20
64015577--64015628
25
2.1
25
100
0
104
30
3
7
57
1.45
64015630--64015675
20
2.3
20
96
0
83
67
0
26
6
1.15
64016263--64016323
16
4.0
15
72
18
54
36
1
0
62
1.05
64017648--64017686
20
2.0
20
89
0
60
23
35
28
12
1.91
64019117--64019324
40
5.2
40
81
2
222
26
26
20
25
1.99
64021326--64021358
17
2.1
16
88
11
50
30
0
0
69
0.88
64021405--64021463
21
2.8
22
85
7
70
23
0
6
69
1.12
64021434--64021493
26
2.4
24
83
8
75
28
0
3
68
1.05
64024090--64024253
40
4.1
40
81
4
170
25
28
21
25
1.99
64024090--64024253
80
2.0
80
82
2
195
25
28
21
25
1.99
64032208--64032371
40
4.1
40
81
4
170
25
28
21
25
1.99
64032208--64032371
80
2.0
80
82
2
195
25
28
21
25
1.99
64034551--64034634
44
1.9
44
92
0
141
35
29
15
19
1.92
64042954--64043084
44
3.0
44
85
7
151
32
27
19
20
1.97
64053728--64053825
48
2.0
48
98
0
187
30
23
8
37
1.84
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
64056785--64057097
76
4.1
75
81
3
225
31
19
22
26
1.98
64056902--64057113
76
2.8
76
86
0
289
32
20
22
25
1.98
64056820--64057113
152
1.9
152
83
0
381
32
19
22
25
1.97
64058413--64058453
21
1.9
22
85
5
57
51
14
0
34
1.43
64063494--64063546
18
2.9
18
76
15
56
52
9
26
11
1.67
64063765--64064014
76
3.4
75
84
7
314
37
6
10
45
1.65
64063875--64064062
64
2.8
65
80
9
191
42
7
7
42
1.62
64065900--64066156
39
6.5
39
89
1
372
28
27
24
20
1.99
64066175--64066204
2
15.0
2
100
0
60
50
0
0
50
1.00
64072417--64072573
39
4.0
39
89
2
183
31
28
21
17
1.96
64072592--64072649
2
29.0
2
96
0
107
50
1
0
48
1.11
64076231--64076542
39
8.0
39
93
0
518
22
29
26
22
1.99
64078550--64078667
59
2.0
59
100
0
236
37
10
16
35
1.83
64080196--64080381
48
4.0
48
77
9
195
26
19
24
29
1.98
64085306--64085621
158
2.0
158
98
0
605
36
19
11
32
1.88
64086073--64086123
21
2.4
21
86
0
75
23
35
5
35
1.79
64092014--64092081
33
2.1
33
91
0
109
30
19
22
27
1.97
64096052--64096076
12
2.1
12
100
0
50
52
8
8
32
1.60
64099485--64099557
29
2.5
29
93
0
101
26
31
16
26
1.96
64099679--64099707
2
14.5
2
100
0
58
48
0
0
51
1.00
64104749--64104798
26
1.9
26
91
0
82
42
4
22
32
1.72
64109608--64109781
47
3.7
47
77
12
178
30
28
18
22
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
64109616--64109787
94
1.8
93
87
1
254
29
27
19
22
1.98
64111389--64111566
46
3.9
44
81
13
173
28
20
29
22
1.98
64112698--64112738
22
1.9
22
90
5
66
9
41
29
19
1.83
64116874--64117033
29
5.5
29
83
4
180
25
30
16
27
1.97
64120227--64120397
93
1.8
93
88
2
263
29
27
19
23
1.98
64120219--64120388
46
3.7
47
76
13
190
30
28
18
22
1.97
64124974--64125146
46
3.8
44
79
11
161
26
19
30
24
1.98
64125275--64125301
2
13.5
2
100
0
54
51
0
0
48
1.00
64126262--64126302
22
1.9
22
95
5
75
9
43
29
17
1.80
64130299--64130349
27
1.9
27
84
4
68
68
1
1
27
1.11

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410