Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr13 124041150 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  124041150

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  383  of  410  ( 49152 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
116335390--116335416
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1.9
14
100
0
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7
0
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1.12
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2.0
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0
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63
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5
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1.47
116343274--116343298
2
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100
0
50
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0
1.00
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2.9
23
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53
6
0
39
1.28
116346061--116346218
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17
63
23
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53
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3
35
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2.8
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16
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37
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67
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33
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12
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0
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1.9
19
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2.4
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13
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3
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2.5
30
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10
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56
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2
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2.0
21
100
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2.0
113
100
0
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16
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0
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4
45
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30
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2.8
18
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3
57
68
0
6
26
1.13
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3.3
27
79
9
88
68
0
3
27
1.06
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10
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53
29
0
0
70
0.87
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30
2.4
29
77
8
74
30
0
0
69
0.88
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
116358639--116358704
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2.0
33
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5
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1
4
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1.29
116361347--116361395
22
2.2
23
96
3
91
20
20
4
55
1.60
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85
2.0
85
100
0
340
29
25
20
24
1.99
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84
2.0
84
94
0
293
20
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13
39
1.90
116371362--116371428
33
2.0
33
97
0
125
32
23
16
26
1.96
116372115--116372166
22
2.4
22
80
0
59
61
11
9
17
1.55
116373119--116373166
19
2.6
18
90
9
78
72
0
10
16
1.10
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2
0
27
0.98
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1.15
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6
11.8
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69
16
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49
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20
1.79
116378966--116379030
25
2.6
25
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0
85
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1.81
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3.0
22
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23
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1.97
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644
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20
20
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1.97
116380413--116380780
27
13.7
26
81
5
272
30
8
21
38
1.84
116380523--116380780
27
9.6
27
85
0
311
31
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20
40
1.82
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5
7.4
5
100
0
74
40
18
21
18
1.91
116402237--116402330
35
2.8
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9
100
40
2
0
57
1.11
116402290--116402350
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2.3
26
83
8
70
44
4
0
50
1.23
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13
4.4
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20
51
40
0
1
58
1.09
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2.1
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90
24
3
14
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1.51
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11
2.6
11
100
0
58
20
0
0
79
0.74
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
116404042--116404079
2
19.5
2
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0
0
50
1.00
116408314--116408353
21
1.9
21
85
10
55
32
30
17
20
1.95
116410255--116410354
24
4.1
24
77
1
92
44
6
35
15
1.71
116410268--116410386
48
2.5
48
87
5
161
42
3
35
19
1.68
116411846--116411991
71
2.1
71
100
0
292
43
8
26
21
1.82
116413839--116413909
21
3.2
21
65
27
56
40
11
23
23
1.87
116413839--116414156
46
6.9
46
89
1
431
41
14
22
20
1.89
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11
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41
0
0
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0
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0
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3
0
67
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107
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31
16
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22
21
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1.99
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0
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3.8
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10
51
34
2
2
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1.24
Indices
Period
Size
Copy
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Consensus
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Percent
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Percent
Indels
Score
A
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G
T
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(0-2)
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0
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2.4
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19
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36
4
4
53
1.44
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
A
C
G
T
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(0-2)
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0
1.24
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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55
1
0
42
1.10

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410