Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr13 124041150 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  124041150

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  128  of  410  ( 49152 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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Period
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Copy
Number
Consensus
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Percent
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Score
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4.0
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26
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27
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24
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165
23
24
28
23
2.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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25
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1.99
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15
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1.94
Indices
Period
Size
Copy
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A
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(0-2)
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3
138
42
10
22
23
1.85
38728157--38728209
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2.0
27
92
0
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16
11
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41
1.84
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2
19.0
2
94
0
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0
0
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1.00
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2
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2
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0
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53
0
0
46
1.00
38747350--38747450
28
3.5
28
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28
25
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1.95
38747380--38747450
30
2.5
28
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4
88
30
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14
28
1.95
38752490--38752521
12
2.7
12
95
0
55
18
6
0
75
1.01
38756679--38756989
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27
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410
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38758343--38758421
20
4.0
20
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0
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30
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38758367--38758422
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1.89
38758472--38758614
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24
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200
29
22
21
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1.99
38758472--38758614
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3.0
47
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198
29
22
21
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1.99
38758472--38758615
71
2.0
72
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211
29
22
21
26
1.99
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2.1
31
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0
101
35
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23
1.94
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26
23
2.00
38761677--38761807
40
3.3
40
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25
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27
24
2.00
38763424--38763581
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42
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1.94
38763424--38763581
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1.9
84
85
6
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30
24
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1.94
38769488--38769708
46
4.8
46
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10
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28
29
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20
1.98
38772092--38772179
29
3.0
29
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8
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56
15
17
10
1.66
38772092--38772170
15
5.4
15
77
10
83
58
13
17
10
1.63
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
38772103--38772179
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15
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9
77
55
15
16
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1.68
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25
2.0
25
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1
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1.67
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40
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23
27
24
25
2.00
38782963--38783132
40
4.3
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1.99
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24
21
1.99
38790998--38791174
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4
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28
22
25
23
1.99
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1.60
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1
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24
27
24
2.00
38808067--38808251
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2.3
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7
218
24
23
27
24
2.00
38811948--38811994
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2.8
17
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0
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100
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100
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26
17
26
1.98
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150
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1.98
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250
2.0
248
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733
29
26
17
25
1.98
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20
2.0
20
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0
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1.79
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42
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29
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4.3
29
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1
189
25
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29
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1.94
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27
1.96
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40
3.7
41
83
2
194
30
26
18
24
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
38835405--38835555
81
1.9
81
85
2
214
30
26
18
24
1.98
38839890--38840254
46
7.9
46
94
0
577
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23
14
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1.90
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0
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0
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0
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16
0
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2.8
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26
26
1.93
38856550--38856777
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4.6
52
73
13
185
25
26
17
29
1.98

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410